More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2477 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  100 
 
 		 154 aa  317  3.9999999999999996e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  69.93 
 
 		 167 aa  231  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3163  AsnC family transcriptional regulator  69.33 
 
 		 150 aa  223  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2774  AsnC family transcriptional regulator  70.67 
 
 		 150 aa  217  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315931  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0500  AsnC family transcriptional regulator  63.45 
 
 		 150 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 172 aa  190  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06912  transcriptional regulator  58.28 
 
 		 171 aa  186  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1042  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  55.78 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000908  transcriptional regulator AsnC family  61.11 
 
 		 126 aa  164  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.499259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1316  AsnC family transcriptional regulator  58.72 
 
 		 110 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  44.52 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  43.36 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 		 167 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  41.78 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  41.78 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  41.78 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  42.66 
 
 		 165 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1629  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00470119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  41.38 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  43.15 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  43.15 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  43.15 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 152 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 152 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 159 aa  123  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 177 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  44.44 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 		 154 aa  123  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  42.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  42.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  42.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  42.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  42.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  42.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  42.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  42.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  42.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  42.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  42.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  42.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  42.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  42.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 196 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  44.6 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2419  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0399  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1428  transcriptional regulator, AsnC family  47.3 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2760  leucine-responsive transcriptional regulator  41.61 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  41.78 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  42.07 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  42.66 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  42.07 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  42.07 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  42.07 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  42.07 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  42.36 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  44.83 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 181 aa  120  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3320  AsnC family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0097323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  42.66 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  44.44 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  44.97 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>