252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1381 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1381  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.263783  normal  0.318048 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  37.12 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  35.19 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  32.77 
 
 
249 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0875  protein of unknown function DUF45  34.8 
 
 
240 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2732  hypothetical protein  32.92 
 
 
240 aa  105  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  32.58 
 
 
232 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0073  protein of unknown function DUF45  32.08 
 
 
316 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.658711 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  34.43 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  29.91 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  90.9  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  30.08 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1657  protein of unknown function DUF45  31.09 
 
 
244 aa  85.1  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  34.21 
 
 
241 aa  85.1  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  27.78 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  27.32 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0904  hypothetical protein  29.05 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  30.57 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  27.32 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  32.32 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  26.48 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  29.39 
 
 
249 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  27.39 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  30.84 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  30.21 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  30.57 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  28.25 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  29.5 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  28.32 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  30.14 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  34.18 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  27.52 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  26.39 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  27.52 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  25.55 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  26.29 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  25.77 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  27.49 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  28.18 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  27.49 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  27.49 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  27.49 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  27.49 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  27.7 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  27.49 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  30.66 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  27.49 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  27.49 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  27.06 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  27.49 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  26.72 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  27.23 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  27.27 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  35.9 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  26.76 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  26.76 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  26.76 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  25.24 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  29.55 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  25.97 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  26.76 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  25.23 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  28.5 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  27.92 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  27.73 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  26.61 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  23.12 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  29.22 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  27.35 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  23.79 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  24.89 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  31.78 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  24.36 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  28.04 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  24 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  23.3 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  29.95 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  38.32 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  27.95 
 
 
256 aa  65.1  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  27.39 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  26.67 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  30.77 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  24.64 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  24.19 
 
 
340 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  24.49 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  23.86 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  28.37 
 
 
314 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  27.9 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  27.67 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  25.12 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  35.64 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  23.92 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  22.79 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  24.31 
 
 
300 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  38.67 
 
 
308 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  25.93 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  40.54 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  25.48 
 
 
237 aa  62  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  30.25 
 
 
318 aa  62  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>