129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1340 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1340  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 
369 aa  757    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.206916  normal  0.62613 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1436  tetratricopeptide domain-containing protein  41.73 
 
 
374 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0545969  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0356  Tetratricopeptide TPR_4  42.49 
 
 
402 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0555328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1975  hypothetical protein  44.1 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000448675  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1465  tetratricopeptide domain-containing protein  42.7 
 
 
364 aa  262  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226528  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0934  tetratricopeptide repeat protein  30.41 
 
 
389 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0853  tetratricopeptide repeat protein  26.56 
 
 
424 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.585626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0782  tetratricopeptide repeat protein  26.29 
 
 
424 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0709697 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0912  tetratricopeptide repeat protein  25.81 
 
 
425 aa  99.8  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2566  tetratricopeptide repeat protein  26.72 
 
 
407 aa  96.7  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0185  tetratricopeptide repeat protein  28.12 
 
 
387 aa  96.3  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340896  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4163  tetratricopeptide repeat protein  28.06 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0930  tetratricopeptide repeat protein  27.09 
 
 
390 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0158  tetratricopeptide repeat protein  27.14 
 
 
400 aa  93.2  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.185124  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1388  tetratricopeptide repeat protein  27.78 
 
 
385 aa  93.2  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0712872  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0926  tetratricopeptide repeat protein  27.09 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0571  tetratricopeptide repeat protein  27.09 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1050  tetratricopeptide repeat protein  27.09 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2472  tetratricopeptide repeat protein  26.89 
 
 
385 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.3368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1009  tetratricopeptide repeat protein  27.09 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748562  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1563  tetratricopeptide repeat protein  26.61 
 
 
385 aa  90.5  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2254  tetratricopeptide repeat protein  27.09 
 
 
390 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0749  tetratricopeptide repeat protein  26 
 
 
391 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0880031  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0725  tetratricopeptide repeat protein  25.94 
 
 
409 aa  87  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0176529  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1306  tetratricopeptide repeat protein  25.84 
 
 
403 aa  87  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.250179  hitchhiker  0.00000292633 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2120  tetratricopeptide repeat protein  24.06 
 
 
386 aa  86.7  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000410522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2295  tetratricopeptide repeat protein  24.55 
 
 
386 aa  86.3  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1756  tetratricopeptide repeat protein  25.77 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000020151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1027  hypothetical protein  24.22 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000719629  unclonable  0.0000000000401052 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1546  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0906  hypothetical protein  24.22 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.330727  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1611  tetratricopeptide repeat protein  26.7 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2338  tetratricopeptide repeat protein  25.39 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00445466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02118  tetratricopeptide repeat protein  25.65 
 
 
389 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000128021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2998  tetratricopeptide repeat protein  26.06 
 
 
391 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0827469  hitchhiker  0.0038903 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1378  tetratricopeptide repeat protein  25 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2224  tetratricopeptide repeat protein  25.51 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000811789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0985  tetratricopeptide repeat protein  25.78 
 
 
391 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1374  tetratricopeptide repeat protein  25.15 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2138  tetratricopeptide repeat protein  26.12 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00930218  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02857  tetratricopeptide repeat protein  25.6 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4727  tetratricopeptide repeat protein  26.28 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.841453  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003023  putative heat shock protein  25.15 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000120972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2314  tetratricopeptide repeat protein  23.39 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000283744  hitchhiker  0.000000379293 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0502  tetratricopeptide repeat protein  25.28 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.914976  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0644  tetratricopeptide repeat protein  24.7 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132586  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1533  tetratricopeptide repeat protein  24.7 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1786  tetratricopeptide repeat protein  25.55 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420165 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1502  tetratricopeptide repeat protein  25.3 
 
 
389 aa  77  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018122  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1641  tetratricopeptide repeat protein  24.1 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2879  tetratricopeptide repeat protein  23.74 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1739  tetratricopeptide repeat protein  24.25 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000105333  hitchhiker  0.00275334 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  26.99 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0424  tetratricopeptide repeat protein  23.74 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2990  tetratricopeptide repeat protein  23.74 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2568  tetratricopeptide repeat protein  23.74 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0943  tetratricopeptide repeat protein  23.74 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2942  tetratricopeptide repeat protein  23.74 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0205  tetratricopeptide repeat protein  23.74 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2464  tetratricopeptide repeat protein  28.65 
 
 
389 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000301038  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2799  tetratricopeptide repeat protein  35.77 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000578522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3911  tetratricopeptide repeat protein  35.65 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0297232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2276  tetratricopeptide repeat protein  29.74 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000164995  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1216  tetratricopeptide repeat protein  24.93 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608666  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2069  tetratricopeptide repeat protein  29.74 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265574  unclonable  0.00000000000285968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1927  tetratricopeptide repeat protein  28.27 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000214151  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2393  tetratricopeptide repeat protein  29.74 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2051  tetratricopeptide repeat protein  28.27 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000458235  unclonable  0.0000309501 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3010  tetratricopeptide repeat protein  39.51 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00816471  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3288  tetratricopeptide repeat protein  35.65 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.190691  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3221  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0588004  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2076  tetratricopeptide repeat protein  33.33 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1957  tetratricopeptide repeat protein  33.93 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000379744  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2399  tetratricopeptide repeat protein  28.27 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2154  tetratricopeptide repeat protein  31.28 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00078802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3032  tetratricopeptide repeat protein  33.86 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2073  tetratricopeptide repeat protein  29.23 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000729266  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0924  tetratricopeptide repeat protein  43.24 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.262727  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1068  tetratricopeptide repeat protein  43.24 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.26691  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1980  tetratricopeptide repeat protein  27.75 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000007627  unclonable  0.0000000000727651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1283  tetratricopeptide repeat protein  24.07 
 
 
390 aa  67  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95391  normal  0.767339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2039  tetratricopeptide repeat protein  28.32 
 
 
386 aa  67  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1594  tetratricopeptide repeat protein  23.67 
 
 
392 aa  67  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.632242  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1537  tetratricopeptide repeat protein  22.87 
 
 
392 aa  67  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2247  tetratricopeptide repeat protein  35.04 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2384  N-acetylglucosaminyl transferase-like protein  25.21 
 
 
539 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00894  tetratricopeptide repeat protein  23.76 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0775107  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1915  tetratricopeptide repeat protein  25.68 
 
 
389 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000481977  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2026  tetratricopeptide repeat protein  25.68 
 
 
389 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000487285  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1410  tetratricopeptide repeat protein  28.57 
 
 
401 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0344069  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2234  tetratricopeptide repeat protein  25.68 
 
 
389 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215898  hitchhiker  0.00382092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0967  tetratricopeptide repeat protein  34.48 
 
 
384 aa  63.5  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2367  Tetratricopeptide domain protein  42.25 
 
 
389 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000651113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1914  tetratricopeptide repeat protein  42.25 
 
 
389 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000156513  hitchhiker  3.47203e-22 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2188  tetratricopeptide repeat protein  42.25 
 
 
389 aa  62.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000146225  hitchhiker  0.0000569887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1391  tetratricopeptide repeat protein  42.25 
 
 
389 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.935719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2650  tetratricopeptide repeat protein  34.07 
 
 
389 aa  62.8  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174406  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2346  tetratricopeptide repeat protein  42.25 
 
 
389 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000129079  unclonable  0.0000000238916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1849  tetratricopeptide repeat protein  42.25 
 
 
389 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000245858  unclonable  5.61509e-21 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1508  tetratricopeptide repeat protein  42.25 
 
 
389 aa  62.8  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000376435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>