139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2026 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2367  tetratricopeptide repeat protein  78.95 
 
 		 389 aa  634    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000126783  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2641  tetratricopeptide repeat protein  79.47 
 
 		 389 aa  637    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000590844  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2188  tetratricopeptide repeat protein  78.16 
 
 		 389 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000146225  hitchhiker  0.0000569887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1915  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 389 aa  802    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000481977  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2650  tetratricopeptide repeat protein  87.89 
 
 		 389 aa  708    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174406  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2234  tetratricopeptide repeat protein  99.74 
 
 		 389 aa  800    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215898  hitchhiker  0.00382092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2026  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 389 aa  802    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000487285  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01257  hypothetical protein  77.84 
 
 		 389 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000160117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2367  Tetratricopeptide domain protein  77.84 
 
 		 389 aa  634  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000651113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1914  tetratricopeptide repeat protein  77.84 
 
 		 389 aa  634  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000156513  hitchhiker  3.47203e-22 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01268  hypothetical protein  77.84 
 
 		 390 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000197215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1391  tetratricopeptide repeat protein  77.84 
 
 		 389 aa  634  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.935719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1482  tetratricopeptide repeat protein  77.84 
 
 		 389 aa  634  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000455068  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2346  tetratricopeptide repeat protein  77.84 
 
 		 389 aa  634  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000129079  unclonable  0.0000000238916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1849  tetratricopeptide repeat protein  77.84 
 
 		 389 aa  634  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000245858  unclonable  5.61509e-21 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1508  tetratricopeptide repeat protein  77.84 
 
 		 389 aa  634  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000376435  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1895  tetratricopeptide repeat protein  78.42 
 
 		 389 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000228715  hitchhiker  4.98218e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1441  tetratricopeptide repeat protein  78.68 
 
 		 389 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000153911  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1837  tetratricopeptide repeat protein  78.68 
 
 		 389 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000022719  hitchhiker  0.000343343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1832  tetratricopeptide repeat protein  78.68 
 
 		 389 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00100254  unclonable  2.05101e-30 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1622  tetratricopeptide repeat protein  78.68 
 
 		 389 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000649442  decreased coverage  2.66656e-22 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1702  tetratricopeptide repeat protein  76.84 
 
 		 389 aa  621  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000418527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1735  tetratricopeptide repeat protein  75.53 
 
 		 389 aa  619  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000233751  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1502  tetratricopeptide repeat protein  56.56 
 
 		 389 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02857  tetratricopeptide repeat protein  54.97 
 
 		 391 aa  455  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2224  tetratricopeptide repeat protein  52.89 
 
 		 389 aa  438  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000811789  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003023  putative heat shock protein  52.55 
 
 		 373 aa  428  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000120972  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1756  tetratricopeptide repeat protein  46.53 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000020151  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2120  tetratricopeptide repeat protein  46.02 
 
 		 386 aa  368  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000410522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2295  tetratricopeptide repeat protein  45.5 
 
 		 386 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2076  tetratricopeptide repeat protein  46.55 
 
 		 386 aa  361  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2314  tetratricopeptide repeat protein  46.27 
 
 		 386 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000283744  hitchhiker  0.000000379293 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0973  tetratricopeptide repeat protein  45.1 
 
 		 398 aa  358  9.999999999999999e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000517245  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1957  tetratricopeptide repeat protein  45.9 
 
 		 386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000379744  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2399  tetratricopeptide repeat protein  44.22 
 
 		 386 aa  352  5e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2393  tetratricopeptide repeat protein  45.76 
 
 		 386 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2069  tetratricopeptide repeat protein  45.76 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265574  unclonable  0.00000000000285968 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3010  tetratricopeptide repeat protein  44.87 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00816471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2073  tetratricopeptide repeat protein  45.76 
 
 		 386 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000729266  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1927  tetratricopeptide repeat protein  44.73 
 
 		 386 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000214151  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2039  tetratricopeptide repeat protein  44.73 
 
 		 386 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1980  tetratricopeptide repeat protein  44.99 
 
 		 386 aa  349  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000007627  unclonable  0.0000000000727651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2051  tetratricopeptide repeat protein  44.73 
 
 		 386 aa  348  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000458235  unclonable  0.0000309501 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2276  tetratricopeptide repeat protein  45.5 
 
 		 386 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000164995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1739  tetratricopeptide repeat protein  43.7 
 
 		 386 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000105333  hitchhiker  0.00275334 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1374  tetratricopeptide repeat protein  41.13 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1378  tetratricopeptide repeat protein  40.87 
 
 		 389 aa  321  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0644  tetratricopeptide repeat protein  39.9 
 
 		 388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132586  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1533  tetratricopeptide repeat protein  40.1 
 
 		 389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2338  tetratricopeptide repeat protein  37.18 
 
 		 389 aa  296  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00445466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2464  tetratricopeptide repeat protein  39.64 
 
 		 389 aa  295  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000301038  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02118  tetratricopeptide repeat protein  39.95 
 
 		 389 aa  288  9e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000128021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0934  tetratricopeptide repeat protein  38.62 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  38.8 
 
 		 389 aa  270  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1594  tetratricopeptide repeat protein  39.21 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.632242  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1537  tetratricopeptide repeat protein  39.21 
 
 		 392 aa  270  4e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00894  tetratricopeptide repeat protein  37.99 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0775107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1649  tetratricopeptide repeat protein  38.26 
 
 		 392 aa  259  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.165991  normal  0.0903087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0185  tetratricopeptide repeat protein  37.76 
 
 		 387 aa  255  7e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340896  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0749  tetratricopeptide repeat protein  37.73 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0880031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3221  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0588004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0985  tetratricopeptide repeat protein  37.99 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2998  tetratricopeptide repeat protein  37.99 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0827469  hitchhiker  0.0038903 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2154  tetratricopeptide repeat protein  36.98 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00078802  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1546  TPR repeat-containing protein  36.01 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4163  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 		 390 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0926  tetratricopeptide repeat protein  36.68 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0930  tetratricopeptide repeat protein  36.9 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1009  tetratricopeptide repeat protein  36.41 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0571  tetratricopeptide repeat protein  36.41 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1050  tetratricopeptide repeat protein  36.41 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1283  tetratricopeptide repeat protein  36.22 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95391  normal  0.767339 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0424  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2990  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2568  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0943  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2942  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0205  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2879  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 		 389 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2254  tetratricopeptide repeat protein  36.41 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1641  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 		 389 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3032  tetratricopeptide repeat protein  36.22 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0924  tetratricopeptide repeat protein  31.83 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.262727  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1068  tetratricopeptide repeat protein  31.83 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.26691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2138  tetratricopeptide repeat protein  31.79 
 
 		 401 aa  200  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00930218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0959  tetratricopeptide repeat protein  33.16 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.214004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0912  tetratricopeptide repeat protein  30.34 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0782  tetratricopeptide repeat protein  29.24 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0709697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0853  tetratricopeptide repeat protein  29.51 
 
 		 424 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.585626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2247  tetratricopeptide repeat protein  33.42 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1030  tetratricopeptide repeat protein  30.09 
 
 		 390 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.457607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2566  tetratricopeptide repeat protein  30.79 
 
 		 407 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1216  tetratricopeptide repeat protein  31.57 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608666  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0725  tetratricopeptide repeat protein  31.3 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0176529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0967  tetratricopeptide repeat protein  32.38 
 
 		 384 aa  173  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0502  tetratricopeptide repeat protein  30.17 
 
 		 403 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.914976  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0906  hypothetical protein  29.6 
 
 		 384 aa  170  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.330727  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1027  hypothetical protein  29.6 
 
 		 385 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000719629  unclonable  0.0000000000401052 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1306  tetratricopeptide repeat protein  30.43 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.250179  hitchhiker  0.00000292633 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1786  tetratricopeptide repeat protein  30.73 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420165 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>