More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2581 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2581  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 71 aa  146  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0197  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243983  normal  0.255658 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3389  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14531  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  39.06 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7158  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776523  normal  0.018417 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12593  repressor protein  39.13 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3164  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0142  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0927186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3146  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000500747  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  39.06 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1932  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000103733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  39.06 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 69 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  40 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 488 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  35.29 
 
 		 377 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0370  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  47.92 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  45.83 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0533  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 90 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0556  hypothetical protein  46.81 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0057041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4304  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 74 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 432 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  42.31 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 72 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  45 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  44.68 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  41.18 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2365  transcriptional regulator, XRE family  46.81 
 
 		 63 aa  47.4  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.729391 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  41.18 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  41.18 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  41.18 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>