More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0559 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
123 aa  250  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 
93 aa  72  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  39.47 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  39.47 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  39.64 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.37 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  46.05 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  41.18 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  44.78 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  43.94 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  40.85 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  36.14 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  31.96 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
96 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
119 aa  63.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
104 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  37.84 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  37.07 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 
129 aa  62  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
330 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  41.43 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
330 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  41.43 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  34.09 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0423  regulatory protein, ArsR  43.06 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
329 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
114 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0873  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
134 aa  60.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.107087  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  41.43 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
115 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  38.16 
 
 
119 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  41.43 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>