67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0543 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  36.73 
 
 		 181 aa  87.4  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8422  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  30.64 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  30.57 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  26.37 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  28.3 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  27.75 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  33.99 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0443  hypothetical protein  28.9 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220081  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  28.18 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  31.28 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  30.41 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2943  hypothetical protein  27.17 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  34.93 
 
 		 236 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2384  hypothetical protein  24.26 
 
 		 218 aa  50.8  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.857348  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1891  hypothetical protein  24.29 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248989  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1576  hypothetical protein  27.66 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  27.85 
 
 		 313 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  32.16 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  32.16 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  30.73 
 
 		 226 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2514  hypothetical protein  26.02 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0312456  normal  0.44225 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  30.73 
 
 		 226 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  32.4 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  30.25 
 
 		 335 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  33.14 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  32.78 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  27.67 
 
 		 333 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2568  hypothetical protein  53.19 
 
 		 199 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  32.22 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2212  hypothetical protein  27.93 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.526644  normal  0.367498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1107  hypothetical protein  27.86 
 
 		 246 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0628147  normal  0.0453857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  29.05 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  28.3 
 
 		 304 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2418  hypothetical protein  27.08 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4114  hypothetical protein  27.86 
 
 		 246 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  29.25 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  28.21 
 
 		 287 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4688  protein of unknown function DUF88  26.29 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.706781  normal  0.898673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3645  protein of unknown function DUF88  26.59 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  32.9 
 
 		 228 aa  45.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1465  hypothetical protein  28.21 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  27.67 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  27.11 
 
 		 305 aa  44.7  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  24.56 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  26.46 
 
 		 404 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  30.46 
 
 		 287 aa  43.9  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1847  protein of unknown function DUF88  25.29 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1693  hypothetical protein  36.73 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1873  protein of unknown function DUF88  25.29 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4322  hypothetical protein  25.71 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.833366  normal  0.664553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  26.26 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_007413  Ava_2110  hypothetical protein  25.58 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850864  normal  0.350459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2825  hypothetical protein  38.78 
 
 		 244 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3445  protein of unknown function DUF88  25.93 
 
 		 338 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  28.32 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4322  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  28.32 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1985  cold shock protein  24.38 
 
 		 310 aa  42  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  28.76 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  28.32 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  28.32 
 
 		 191 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1124  hypothetical protein  32.86 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.355557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0029  hypothetical protein  36.73 
 
 		 271 aa  41.2  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2003  hypothetical protein  24.34 
 
 		 213 aa  40.8  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212365  normal  0.0101552 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0106  hypothetical protein  31.43 
 
 		 240 aa  40.8  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>