More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2058 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0039  prolyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 		 508 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0024  prolyl-tRNA synthetase  62.2 
 
 		 510 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0026  prolyl-tRNA synthetase  63.04 
 
 		 510 aa  662    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2058  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 508 aa  1057    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0034  prolyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 506 aa  561  1.0000000000000001e-159  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.599841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2310  prolyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 490 aa  515  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0217  prolyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 491 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000503447  normal  0.017665 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1544  prolyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 492 aa  511  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2271  prolyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4939  prolyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 492 aa  505  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580893  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0277  prolyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 491 aa  496  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.273584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2910  prolyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 490 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104105  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_002950  PG0962  prolyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 493 aa  491  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5952  prolyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 493 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000821965  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3228  prolyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 491 aa  490  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.64525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01055  prolyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 492 aa  489  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1587  prolyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 481 aa  485  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000034459  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0849  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 481 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000760097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1877  prolyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 481 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103164  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0830  prolyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 480 aa  477  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0711  prolyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1696  prolyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1083  prolyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 481 aa  472  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1775  prolyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0313  prolyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 478 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000674041  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1950  prolyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 515 aa  467  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1230  prolyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 527 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1492  prolyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2053  prolyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 480 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.449201 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0405  prolyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 488 aa  457  1e-127  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43097  predicted protein  47.14 
 
 		 671 aa  452  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0089  prolyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 477 aa  451  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8092  prolyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1665  prolyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 483 aa  451  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0469  prolyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2485  prolyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 480 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0435  prolyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 483 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0461  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0863  prolyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0345  prolyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 478 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0373  prolyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 476 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0370  prolyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0440  prolyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0510  prolyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0570  prolyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 497 aa  417  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0510  prolyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0382  prolyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 476 aa  415  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0376  prolyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4863  prolyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 476 aa  415  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2390  prolyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 483 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0382  prolyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 508 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0396  prolyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 508 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.468915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3837  prolyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00668476  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl476  prolyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 473 aa  389  1e-107  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18002  predicted protein  46.01 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1192  prolyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0348  prolyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 471 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1303  prolyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 468 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0658  prolyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4267  prolyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 468 aa  378  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.975115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0318  prolyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.237485  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1087  prolyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.723439  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3132  prolyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.421139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3199  prolyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 493 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2180  prolyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0777  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 491 aa  364  2e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2528  prolyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 493 aa  363  3e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf031  prolyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2695  prolyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 484 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000655749  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84407  proline-tRNA ligase  33.58 
 
 		 682 aa  316  5e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19561  predicted protein  33.14 
 
 		 524 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000000000368339  normal  0.864068 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23547  predicted protein  38.88 
 
 		 479 aa  314  2.9999999999999996e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.034898  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05640  proline-tRNA ligase, putative  33.96 
 
 		 740 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02150  prolyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G16010)  33.21 
 
 		 594 aa  295  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0487  prolyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 472 aa  288  2e-76  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0728  prolyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 465 aa  278  2e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.102661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0179  prolyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 480 aa  276  8e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0190  prolyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.15585  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1640  prolyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 478 aa  249  8e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1366  prolyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 487 aa  242  1e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0234  prolyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 456 aa  242  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0817  prolyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1092  prolyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 		 487 aa  241  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1921  prolyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 480 aa  240  5.999999999999999e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0822  prolyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 		 488 aa  237  3e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62191  normal  0.0638308 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1963  prolyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 478 aa  237  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.914598 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0803  prolyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 488 aa  236  7e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1386  prolyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 		 477 aa  232  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.399979  normal  0.968589 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1574  prolyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1972  prolyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 481 aa  229  8e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1635  prolyl-tRNA synthetase  29.42 
 
 		 481 aa  229  9e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1139  prolyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 478 aa  229  9e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1723  prolyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 460 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.612812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0945  prolyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 		 479 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258723  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2042  prolyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 477 aa  224  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0880  prolyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 460 aa  224  4e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0188  prolyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0918  prolyl-tRNA synthetase  25.88 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1739  prolyl-tRNA synthetase  23.44 
 
 		 498 aa  73.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350453  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3276  prolyl-tRNA synthetase  23 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>