More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1230 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1950  prolyl-tRNA synthetase  72.46 
 
 		 515 aa  771    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1230  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 527 aa  1084    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0026  prolyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0034  prolyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 506 aa  503  1e-141  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.599841 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0024  prolyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 510 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0039  prolyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 508 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2058  prolyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 508 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01055  prolyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 492 aa  457  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2271  prolyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 496 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4939  prolyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 492 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580893  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5952  prolyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 493 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000821965  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1544  prolyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0217  prolyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000503447  normal  0.017665 
 
 
-
 
NC_002950  PG0962  prolyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2910  prolyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 490 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104105  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3228  prolyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.64525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43097  predicted protein  46.33 
 
 		 671 aa  429  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2310  prolyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 490 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8092  prolyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0277  prolyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 491 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.273584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2053  prolyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 480 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.449201 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0830  prolyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 480 aa  411  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1775  prolyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0863  prolyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 477 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1587  prolyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 481 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000034459  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1877  prolyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 481 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103164  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1696  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 481 aa  392  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1665  prolyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0313  prolyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000674041  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0405  prolyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 488 aa  389  1e-107  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0849  prolyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000760097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0510  prolyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0373  prolyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0370  prolyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1492  prolyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 481 aa  385  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0711  prolyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 481 aa  383  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0376  prolyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 476 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4863  prolyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0510  prolyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0348  prolyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 471 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0345  prolyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0461  prolyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 476 aa  382  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0440  prolyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 476 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1192  prolyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 468 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1083  prolyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 481 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0382  prolyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0396  prolyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.468915  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1303  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0435  prolyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4267  prolyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.975115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0382  prolyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0469  prolyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2485  prolyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 480 aa  362  6e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2390  prolyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 483 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18002  predicted protein  45.21 
 
 		 448 aa  358  9.999999999999999e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2180  prolyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 468 aa  357  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0089  prolyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 477 aa  357  3.9999999999999996e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3132  prolyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 484 aa  349  6e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.421139 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0570  prolyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267387  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl476  prolyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 473 aa  342  1e-92  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3837  prolyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 477 aa  341  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00668476  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0777  prolyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0318  prolyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 474 aa  332  9e-90  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.237485  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2695  prolyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000655749  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf031  prolyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 476 aa  323  5e-87  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0658  prolyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 480 aa  322  8e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19561  predicted protein  36.68 
 
 		 524 aa  319  7e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000000000368339  normal  0.864068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1087  prolyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 476 aa  316  7e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.723439  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3199  prolyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 493 aa  313  4.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2528  prolyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 493 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23547  predicted protein  36.82 
 
 		 479 aa  304  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.034898  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84407  proline-tRNA ligase  33.9 
 
 		 682 aa  301  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05640  proline-tRNA ligase, putative  36.18 
 
 		 740 aa  300  5e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0487  prolyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02150  prolyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G16010)  36.08 
 
 		 594 aa  274  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0728  prolyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 465 aa  259  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.102661  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1921  prolyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 480 aa  248  2e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1139  prolyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 478 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0179  prolyl-tRNA synthetase  31.55 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1640  prolyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0190  prolyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.15585  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0817  prolyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 482 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1972  prolyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 481 aa  237  4e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0803  prolyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 488 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1574  prolyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 		 461 aa  234  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0234  prolyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 456 aa  233  5e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0188  prolyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 460 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1723  prolyl-tRNA synthetase  31.8 
 
 		 460 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.612812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1092  prolyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 		 487 aa  232  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0880  prolyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 		 460 aa  229  8e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.276664  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1366  prolyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 		 487 aa  226  9e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1386  prolyl-tRNA synthetase  32.34 
 
 		 477 aa  225  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.399979  normal  0.968589 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0822  prolyl-tRNA synthetase  31.95 
 
 		 488 aa  223  8e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62191  normal  0.0638308 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1635  prolyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 481 aa  223  9e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1963  prolyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 		 478 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.914598 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2042  prolyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0945  prolyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 		 479 aa  212  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258723  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1371  prolyl-tRNA synthetase  26.24 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0918  prolyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1279  prolyl-tRNA synthetase  25.69 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193601  normal  0.818209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>