More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1665 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1665  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
483 aa  1001    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0830  prolyl-tRNA synthetase  59.83 
 
 
480 aa  625  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0435  prolyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 
483 aa  586  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0345  prolyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 
478 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0510  prolyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 
476 aa  557  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0373  prolyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
476 aa  557  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0370  prolyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 
476 aa  555  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0382  prolyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
476 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0510  prolyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 
476 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0440  prolyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 
476 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0461  prolyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
476 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4863  prolyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 
476 aa  554  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0376  prolyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 
476 aa  552  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2390  prolyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 
483 aa  549  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3837  prolyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 
477 aa  545  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00668476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0382  prolyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
508 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0396  prolyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
508 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.468915  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1087  prolyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 
476 aa  539  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.723439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1696  prolyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 
481 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1877  prolyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
481 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103164  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1587  prolyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
481 aa  533  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000034459  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0089  prolyl-tRNA synthetase  56 
 
 
477 aa  528  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0711  prolyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 
481 aa  531  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1083  prolyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 
481 aa  526  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0849  prolyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 
481 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000760097  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1775  prolyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 
480 aa  526  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2271  prolyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
496 aa  525  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2053  prolyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 
480 aa  524  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.449201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5952  prolyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
493 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000821965  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2910  prolyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
490 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104105  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1492  prolyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 
481 aa  509  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0469  prolyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 
477 aa  506  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0962  prolyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
493 aa  502  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0277  prolyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
491 aa  503  1e-141  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.273584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0217  prolyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
491 aa  498  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000503447  normal  0.017665 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1544  prolyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
492 aa  499  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8092  prolyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 
480 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2310  prolyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
490 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317446 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18002  predicted protein  54.12 
 
 
448 aa  488  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938893  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01055  prolyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
492 aa  488  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl476  prolyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
473 aa  486  1e-136  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0313  prolyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 
478 aa  481  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000674041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4939  prolyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
492 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2485  prolyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
480 aa  484  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0318  prolyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
474 aa  478  1e-134  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.237485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0863  prolyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
477 aa  478  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0405  prolyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
488 aa  477  1e-133  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0658  prolyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
480 aa  476  1e-133  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3228  prolyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
491 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.64525  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3199  prolyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
493 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3132  prolyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.421139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0026  prolyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
510 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2058  prolyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
508 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2528  prolyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
493 aa  449  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0024  prolyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
510 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0039  prolyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
508 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0570  prolyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267387  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0777  prolyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4267  prolyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 
468 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.975115  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0348  prolyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 
471 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2695  prolyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
484 aa  429  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000655749  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0034  prolyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
506 aa  426  1e-118  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.599841 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05640  proline-tRNA ligase, putative  41.32 
 
 
740 aa  413  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf031  prolyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
476 aa  413  1e-114  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19561  predicted protein  43 
 
 
524 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000000000368339  normal  0.864068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1192  prolyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84407  proline-tRNA ligase  40.84 
 
 
682 aa  403  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1303  prolyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
468 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43097  predicted protein  43.85 
 
 
671 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1950  prolyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
515 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1230  prolyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
527 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2180  prolyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
468 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23547  predicted protein  42.5 
 
 
479 aa  385  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.034898  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0728  prolyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
465 aa  375  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.102661  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0817  prolyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
482 aa  373  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02150  prolyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G16010)  40.63 
 
 
594 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0487  prolyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
472 aa  367  1e-100  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0179  prolyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
480 aa  349  5e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0190  prolyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
478 aa  341  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.15585  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1921  prolyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
480 aa  339  5.9999999999999996e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1635  prolyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
481 aa  325  1e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1640  prolyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
478 aa  325  2e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1139  prolyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
478 aa  316  6e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1972  prolyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
481 aa  315  9.999999999999999e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2042  prolyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
477 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0822  prolyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
488 aa  303  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62191  normal  0.0638308 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1574  prolyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
461 aa  301  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1092  prolyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
487 aa  300  4e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1366  prolyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
487 aa  296  5e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0234  prolyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
456 aa  294  2e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1723  prolyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
460 aa  292  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.612812 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1386  prolyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
477 aa  291  2e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.399979  normal  0.968589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0945  prolyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
479 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258723  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0880  prolyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
460 aa  289  1e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0803  prolyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
488 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138093  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0188  prolyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1963  prolyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 
478 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.914598 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  24.3 
 
 
640 aa  87.4  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0813  prolyl-tRNA synthetase  22.75 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01383  threonyl-tRNA synthetase  24.03 
 
 
649 aa  84.3  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>