More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1921 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1635  prolyl-tRNA synthetase  63.62 
 
 		 481 aa  680    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1921  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 480 aa  987    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1972  prolyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 481 aa  491  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0803  prolyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 488 aa  492  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1366  prolyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 487 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0822  prolyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 		 488 aa  492  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62191  normal  0.0638308 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1092  prolyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 487 aa  489  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0190  prolyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 478 aa  482  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.15585  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0179  prolyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1139  prolyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1640  prolyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0728  prolyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.102661  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1963  prolyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.914598 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1386  prolyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 477 aa  432  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.399979  normal  0.968589 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0234  prolyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2042  prolyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 477 aa  430  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0945  prolyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258723  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1723  prolyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.612812 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0880  prolyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 460 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0188  prolyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 460 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1574  prolyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 461 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0817  prolyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 482 aa  370  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0830  prolyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 480 aa  362  6e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1665  prolyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 483 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0435  prolyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 483 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0461  prolyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 476 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0510  prolyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 476 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0370  prolyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 476 aa  323  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0373  prolyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 476 aa  322  8e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0440  prolyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 476 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4863  prolyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 476 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0510  prolyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 476 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0345  prolyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 478 aa  319  6e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0382  prolyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0658  prolyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 480 aa  316  5e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0376  prolyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 476 aa  315  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0382  prolyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 508 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0396  prolyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 508 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.468915  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2390  prolyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3132  prolyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.421139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0469  prolyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 477 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0570  prolyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 497 aa  303  7.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3199  prolyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 493 aa  302  8.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0089  prolyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 477 aa  299  7e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2528  prolyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 493 aa  297  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1087  prolyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 476 aa  295  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.723439  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0777  prolyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 491 aa  294  2e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2271  prolyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 496 aa  293  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4939  prolyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 492 aa  290  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580893  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2695  prolyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 		 484 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000655749  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0711  prolyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5952  prolyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000821965  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3837  prolyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 477 aa  286  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00668476  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01055  prolyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 492 aa  286  5e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1696  prolyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 481 aa  286  5e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1877  prolyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 481 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103164  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0405  prolyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 		 488 aa  285  2.0000000000000002e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0217  prolyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 491 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000503447  normal  0.017665 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1587  prolyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 481 aa  283  6.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000034459  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0849  prolyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 481 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000760097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1544  prolyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 		 492 aa  278  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1775  prolyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 480 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0277  prolyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 491 aa  276  4e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.273584 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84407  proline-tRNA ligase  32.73 
 
 		 682 aa  277  4e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0863  prolyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 477 aa  276  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2053  prolyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 480 aa  276  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.449201 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0313  prolyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 478 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000674041  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl476  prolyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 473 aa  274  3e-72  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2910  prolyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 490 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104105  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0318  prolyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 474 aa  271  1e-71  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.237485  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1492  prolyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8092  prolyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 480 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1083  prolyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3228  prolyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.64525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19561  predicted protein  31.61 
 
 		 524 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000000000368339  normal  0.864068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2310  prolyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 490 aa  265  8.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317446 
 
 
-
 
NC_002950  PG0962  prolyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 493 aa  262  1e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05640  proline-tRNA ligase, putative  30.43 
 
 		 740 aa  260  3e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18002  predicted protein  35.63 
 
 		 448 aa  259  9e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2180  prolyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 		 468 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0348  prolyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 471 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf031  prolyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 		 476 aa  252  1e-65  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23547  predicted protein  32.92 
 
 		 479 aa  250  4e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.034898  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1230  prolyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 527 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0026  prolyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 		 510 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0039  prolyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0024  prolyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 		 510 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02150  prolyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G16010)  33.18 
 
 		 594 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2485  prolyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 480 aa  242  9e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1303  prolyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2058  prolyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 508 aa  240  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4267  prolyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.975115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1192  prolyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43097  predicted protein  31.08 
 
 		 671 aa  234  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1950  prolyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 515 aa  229  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0034  prolyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 		 506 aa  223  6e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.599841 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0487  prolyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 		 472 aa  213  9e-54  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1739  prolyl-tRNA synthetase  24.7 
 
 		 498 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350453  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0813  prolyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4302  Prolyl-tRNA synthetase-like protein  23.89 
 
 		 474 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>