More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1083 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2271  prolyl-tRNA synthetase  63.25 
 
 		 496 aa  643    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1696  prolyl-tRNA synthetase  83.16 
 
 		 481 aa  853    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1587  prolyl-tRNA synthetase  80.46 
 
 		 481 aa  840    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000034459  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1492  prolyl-tRNA synthetase  87.32 
 
 		 481 aa  871    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0711  prolyl-tRNA synthetase  83.99 
 
 		 481 aa  860    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0849  prolyl-tRNA synthetase  80.67 
 
 		 481 aa  833    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000760097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1083  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 481 aa  1001    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1877  prolyl-tRNA synthetase  87.32 
 
 		 481 aa  893    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103164  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0962  prolyl-tRNA synthetase  62.22 
 
 		 493 aa  616  1e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2310  prolyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 		 490 aa  605  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2910  prolyl-tRNA synthetase  59.04 
 
 		 490 aa  598  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104105  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0217  prolyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 491 aa  597  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000503447  normal  0.017665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5952  prolyl-tRNA synthetase  58.08 
 
 		 493 aa  591  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000821965  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1544  prolyl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 492 aa  592  1e-168  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4939  prolyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 		 492 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580893  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01055  prolyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 492 aa  578  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0277  prolyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 		 491 aa  578  1e-164  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.273584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3228  prolyl-tRNA synthetase  58.52 
 
 		 491 aa  571  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.64525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0830  prolyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 480 aa  550  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2053  prolyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 480 aa  550  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.449201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1775  prolyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 480 aa  551  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0435  prolyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 483 aa  534  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1665  prolyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 483 aa  526  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0313  prolyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 478 aa  523  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000674041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1087  prolyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 476 aa  521  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.723439  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0405  prolyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 488 aa  516  1.0000000000000001e-145  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0089  prolyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 477 aa  512  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0469  prolyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 		 477 aa  513  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2485  prolyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 480 aa  509  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0345  prolyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0510  prolyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 476 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0373  prolyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 476 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4863  prolyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 476 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0510  prolyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 476 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0440  prolyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 476 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0461  prolyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 476 aa  501  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0370  prolyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 476 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0376  prolyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 476 aa  500  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8092  prolyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 480 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2390  prolyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 483 aa  497  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0024  prolyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 510 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0039  prolyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 508 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0026  prolyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 510 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0382  prolyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 476 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0382  prolyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 508 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0396  prolyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 508 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.468915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3837  prolyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00668476  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0863  prolyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 477 aa  482  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2058  prolyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 508 aa  472  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18002  predicted protein  52.84 
 
 		 448 aa  463  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0658  prolyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0570  prolyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 497 aa  442  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43097  predicted protein  45.79 
 
 		 671 aa  439  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0348  prolyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0034  prolyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 506 aa  436  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.599841 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf031  prolyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 476 aa  426  1e-118  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl476  prolyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 473 aa  423  1e-117  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2180  prolyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 468 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0318  prolyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 474 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.237485  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4267  prolyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 468 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.975115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1192  prolyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1303  prolyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1950  prolyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 515 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2528  prolyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3199  prolyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19561  predicted protein  40.24 
 
 		 524 aa  380  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000000000368339  normal  0.864068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1230  prolyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 527 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3132  prolyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 484 aa  377  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.421139 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0777  prolyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84407  proline-tRNA ligase  39.41 
 
 		 682 aa  372  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2695  prolyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000655749  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05640  proline-tRNA ligase, putative  37.92 
 
 		 740 aa  360  3e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0487  prolyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 472 aa  351  2e-95  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02150  prolyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G16010)  41.35 
 
 		 594 aa  350  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23547  predicted protein  39.21 
 
 		 479 aa  347  4e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.034898  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0728  prolyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 465 aa  324  3e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.102661  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1972  prolyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 481 aa  300  4e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0179  prolyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 480 aa  294  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0817  prolyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 482 aa  295  2e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0234  prolyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 456 aa  294  3e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0190  prolyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 478 aa  292  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.15585  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1640  prolyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 478 aa  288  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1092  prolyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 487 aa  283  6.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1723  prolyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 460 aa  282  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.612812 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0803  prolyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0822  prolyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62191  normal  0.0638308 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1366  prolyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 487 aa  280  4e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0188  prolyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 460 aa  280  6e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0880  prolyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.276664  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1635  prolyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 481 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1139  prolyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 478 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1574  prolyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 461 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1921  prolyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 480 aa  271  2e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1963  prolyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 478 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.914598 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1386  prolyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 477 aa  268  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.399979  normal  0.968589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0945  prolyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 479 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258723  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2042  prolyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 		 477 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 		 568 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3205  prolyl-tRNA synthetase  22.25 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405464  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 569 aa  83.2  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>