More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0962 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0962  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
493 aa  1031    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0217  prolyl-tRNA synthetase  76.28 
 
 
491 aa  775    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000503447  normal  0.017665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2271  prolyl-tRNA synthetase  66.73 
 
 
496 aa  690    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1544  prolyl-tRNA synthetase  71.02 
 
 
492 aa  738    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5952  prolyl-tRNA synthetase  71.49 
 
 
493 aa  753    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000821965  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2310  prolyl-tRNA synthetase  73.16 
 
 
490 aa  766    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2910  prolyl-tRNA synthetase  70.76 
 
 
490 aa  735    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104105  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4939  prolyl-tRNA synthetase  69.18 
 
 
492 aa  713    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580893  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0277  prolyl-tRNA synthetase  67.08 
 
 
491 aa  698    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.273584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3228  prolyl-tRNA synthetase  70.55 
 
 
491 aa  716    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.64525  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01055  prolyl-tRNA synthetase  68.57 
 
 
492 aa  724    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1083  prolyl-tRNA synthetase  62.22 
 
 
481 aa  629  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1587  prolyl-tRNA synthetase  61.69 
 
 
481 aa  625  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000034459  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1877  prolyl-tRNA synthetase  61.49 
 
 
481 aa  627  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103164  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1696  prolyl-tRNA synthetase  61.21 
 
 
481 aa  618  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0711  prolyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 
481 aa  616  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0849  prolyl-tRNA synthetase  60.93 
 
 
481 aa  609  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000760097  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1492  prolyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 
481 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0830  prolyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 
480 aa  552  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1775  prolyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 
480 aa  550  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2053  prolyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 
480 aa  544  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.449201 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0026  prolyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
510 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0024  prolyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 
510 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43097  predicted protein  53.07 
 
 
671 aa  533  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0313  prolyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 
478 aa  529  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000674041  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0039  prolyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
508 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0089  prolyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 
477 aa  527  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0469  prolyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 
477 aa  517  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0345  prolyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 
478 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0435  prolyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 
483 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2485  prolyl-tRNA synthetase  54.02 
 
 
480 aa  510  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1665  prolyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
483 aa  509  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8092  prolyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 
480 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2058  prolyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
508 aa  501  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0405  prolyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
488 aa  498  1e-140  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2390  prolyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 
483 aa  501  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0863  prolyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 
477 aa  500  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0461  prolyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
476 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0376  prolyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
476 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0373  prolyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
476 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4863  prolyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
476 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0510  prolyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
476 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0034  prolyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
506 aa  492  9.999999999999999e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.599841 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0440  prolyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
476 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0510  prolyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
476 aa  490  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0370  prolyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
476 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1087  prolyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 
476 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.723439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0382  prolyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
476 aa  478  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0382  prolyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
508 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0396  prolyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
508 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.468915  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0658  prolyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
480 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0570  prolyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
497 aa  461  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267387  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3837  prolyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
477 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00668476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1950  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
515 aa  453  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1230  prolyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
527 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18002  predicted protein  50.22 
 
 
448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938893  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0318  prolyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
474 aa  444  1e-123  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.237485  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl476  prolyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
473 aa  441  9.999999999999999e-123  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2180  prolyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
468 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0348  prolyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
471 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf031  prolyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
476 aa  438  1e-121  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4267  prolyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
468 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.975115  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19561  predicted protein  42.69 
 
 
524 aa  417  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000000000368339  normal  0.864068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1303  prolyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
468 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1192  prolyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
468 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3132  prolyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
484 aa  388  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.421139 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0487  prolyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
472 aa  385  1e-106  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84407  proline-tRNA ligase  39.65 
 
 
682 aa  384  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2528  prolyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
493 aa  382  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3199  prolyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
493 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2695  prolyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
484 aa  372  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000655749  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0777  prolyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
491 aa  370  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.941817 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02150  prolyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G16010)  41.45 
 
 
594 aa  365  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23547  predicted protein  39.01 
 
 
479 aa  360  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.034898  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05640  proline-tRNA ligase, putative  37.43 
 
 
740 aa  356  5.999999999999999e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0728  prolyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
465 aa  306  6e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.102661  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0817  prolyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
482 aa  306  6e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0822  prolyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
488 aa  299  9e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62191  normal  0.0638308 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1092  prolyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
487 aa  298  2e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0179  prolyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
480 aa  295  9e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0803  prolyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
488 aa  294  2e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138093  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1366  prolyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
487 aa  295  2e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1972  prolyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
481 aa  294  3e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0190  prolyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 
478 aa  292  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.15585  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0234  prolyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 
456 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1640  prolyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
478 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2042  prolyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 
477 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1921  prolyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 
480 aa  268  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1723  prolyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
460 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.612812 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1386  prolyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 
477 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.399979  normal  0.968589 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0880  prolyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
460 aa  263  6e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0188  prolyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
460 aa  262  8e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1574  prolyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
461 aa  259  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1139  prolyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 
478 aa  258  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1635  prolyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 
481 aa  254  3e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1963  prolyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 
478 aa  254  4.0000000000000004e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.914598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0945  prolyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
479 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258723  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2597  prolyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 
439 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.700725  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_002978  WD0813  prolyl-tRNA synthetase  21.6 
 
 
422 aa  94  5e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 
569 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>