More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0777 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3132  prolyl-tRNA synthetase  77.1 
 
 
484 aa  777    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.421139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3199  prolyl-tRNA synthetase  74.19 
 
 
493 aa  761    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2695  prolyl-tRNA synthetase  75.56 
 
 
484 aa  754    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000655749  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0777  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
491 aa  1005    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2528  prolyl-tRNA synthetase  73.59 
 
 
493 aa  751    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1665  prolyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0435  prolyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2390  prolyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
483 aa  443  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0658  prolyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
480 aa  437  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1087  prolyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
476 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.723439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0345  prolyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
478 aa  433  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139585  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0830  prolyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
480 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0089  prolyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
477 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3837  prolyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
477 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00668476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0461  prolyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
476 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0510  prolyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
476 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0373  prolyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
476 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0376  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
476 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0469  prolyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
477 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4863  prolyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
476 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0370  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0510  prolyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
476 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0440  prolyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0405  prolyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
488 aa  413  1e-114  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0382  prolyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
508 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0396  prolyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
508 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.468915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0382  prolyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
476 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2271  prolyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
496 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84407  proline-tRNA ligase  41.67 
 
 
682 aa  403  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0711  prolyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
481 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0849  prolyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
481 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000760097  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05640  proline-tRNA ligase, putative  41.05 
 
 
740 aa  397  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1775  prolyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
480 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl476  prolyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
473 aa  393  1e-108  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01055  prolyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
492 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2053  prolyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
480 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.449201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8092  prolyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
480 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1492  prolyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
481 aa  385  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0318  prolyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
474 aa  385  1e-106  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.237485  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4939  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
492 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580893  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1696  prolyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
481 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1877  prolyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
481 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0863  prolyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
477 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0277  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
491 aa  385  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.273584 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1587  prolyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
481 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000034459  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1544  prolyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
492 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2910  prolyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
490 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104105  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02150  prolyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G16010)  40.54 
 
 
594 aa  379  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2310  prolyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
490 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317446 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23547  predicted protein  44.82 
 
 
479 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.034898  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0313  prolyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
478 aa  379  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000674041  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0217  prolyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
491 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000503447  normal  0.017665 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1083  prolyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
481 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5952  prolyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
493 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000821965  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18002  predicted protein  44.96 
 
 
448 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938893  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19561  predicted protein  39.92 
 
 
524 aa  372  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000000000368339  normal  0.864068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3228  prolyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
491 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.64525  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0962  prolyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
493 aa  365  1e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0570  prolyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
497 aa  365  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267387  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2058  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
508 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf031  prolyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
476 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43097  predicted protein  40.91 
 
 
671 aa  354  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2485  prolyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
480 aa  351  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0024  prolyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
510 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4267  prolyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
468 aa  349  7e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.975115  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0026  prolyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 
510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0039  prolyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
508 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0034  prolyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
506 aa  338  9.999999999999999e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.599841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0348  prolyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
471 aa  337  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1230  prolyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
527 aa  335  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0817  prolyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
482 aa  330  3e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1192  prolyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
468 aa  329  6e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1303  prolyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
468 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0179  prolyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0728  prolyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
465 aa  322  7e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.102661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2180  prolyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
468 aa  322  9.000000000000001e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1950  prolyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
515 aa  319  7e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0190  prolyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
478 aa  312  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.15585  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1640  prolyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
478 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0487  prolyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 
472 aa  302  9e-81  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1972  prolyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
481 aa  302  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1635  prolyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 
481 aa  296  7e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1139  prolyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
478 aa  295  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1921  prolyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
480 aa  294  2e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1386  prolyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.399979  normal  0.968589 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1963  prolyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
478 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.914598 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1574  prolyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
461 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1092  prolyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 
487 aa  280  5e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0822  prolyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 
488 aa  280  6e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62191  normal  0.0638308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2042  prolyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 
477 aa  278  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0945  prolyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
479 aa  278  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258723  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0234  prolyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
456 aa  277  3e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0803  prolyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
488 aa  276  5e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138093  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1723  prolyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
460 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.612812 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1366  prolyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
487 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0880  prolyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
460 aa  272  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0188  prolyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
460 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
573 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 
573 aa  93.2  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
578 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>