More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4267 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4267  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 468 aa  942    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.975115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0348  prolyl-tRNA synthetase  84.62 
 
 		 471 aa  784    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1192  prolyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 		 468 aa  633  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1303  prolyl-tRNA synthetase  67.6 
 
 		 468 aa  627  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2180  prolyl-tRNA synthetase  63.09 
 
 		 468 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0863  prolyl-tRNA synthetase  57.05 
 
 		 477 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8092  prolyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 		 480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0711  prolyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 481 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1775  prolyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 480 aa  458  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1696  prolyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 481 aa  457  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1587  prolyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 481 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000034459  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2053  prolyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 480 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.449201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1087  prolyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.723439  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1665  prolyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 483 aa  451  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0849  prolyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 481 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000760097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1492  prolyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0089  prolyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0313  prolyl-tRNA synthetase  50.22 
 
 		 478 aa  444  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000674041  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0962  prolyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2390  prolyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 483 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1083  prolyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1877  prolyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0435  prolyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 483 aa  433  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0469  prolyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2271  prolyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 496 aa  433  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2910  prolyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 490 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104105  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0830  prolyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0217  prolyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 491 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000503447  normal  0.017665 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2485  prolyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 480 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5952  prolyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 493 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000821965  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2310  prolyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 490 aa  425  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317446 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0277  prolyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 491 aa  426  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.273584 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1544  prolyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 492 aa  426  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0382  prolyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 508 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0373  prolyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0370  prolyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0396  prolyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 508 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.468915  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3228  prolyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 491 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.64525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0461  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0510  prolyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 476 aa  418  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4939  prolyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 492 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0376  prolyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0510  prolyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0440  prolyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 476 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4863  prolyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl476  prolyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 473 aa  414  1e-114  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0405  prolyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01055  prolyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 492 aa  411  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0318  prolyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 474 aa  409  1e-113  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.237485  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0345  prolyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0382  prolyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 476 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18002  predicted protein  48.89 
 
 		 448 aa  403  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1950  prolyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 515 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0034  prolyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 506 aa  403  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.599841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2058  prolyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 508 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0024  prolyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0570  prolyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0039  prolyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 508 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0026  prolyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 510 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1230  prolyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 527 aa  388  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3837  prolyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00668476  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43097  predicted protein  44.73 
 
 		 671 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0658  prolyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3132  prolyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.421139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3199  prolyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 493 aa  363  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0777  prolyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 491 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2695  prolyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 484 aa  359  5e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000655749  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2528  prolyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 493 aa  358  9e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf031  prolyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 476 aa  358  9e-98  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05640  proline-tRNA ligase, putative  40.8 
 
 		 740 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19561  predicted protein  39.91 
 
 		 524 aa  348  8e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000000000368339  normal  0.864068 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84407  proline-tRNA ligase  43.95 
 
 		 682 aa  345  8e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02150  prolyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G16010)  43.07 
 
 		 594 aa  333  3e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23547  predicted protein  43.68 
 
 		 479 aa  329  8e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.034898  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0487  prolyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 472 aa  322  9.999999999999999e-87  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0728  prolyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.102661  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0817  prolyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 482 aa  274  3e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1972  prolyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 481 aa  273  5.000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0179  prolyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 480 aa  272  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0190  prolyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 478 aa  270  5e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.15585  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0803  prolyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 		 488 aa  266  4e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1366  prolyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 487 aa  265  2e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1092  prolyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 487 aa  262  1e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1723  prolyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 460 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.612812 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1921  prolyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 480 aa  259  8e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1640  prolyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 478 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0880  prolyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 460 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1574  prolyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 461 aa  256  7e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0822  prolyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 488 aa  256  7e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62191  normal  0.0638308 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0188  prolyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0234  prolyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 456 aa  250  3e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1635  prolyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 481 aa  246  6e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2042  prolyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 477 aa  246  8e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1386  prolyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.399979  normal  0.968589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0945  prolyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258723  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1963  prolyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 478 aa  237  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.914598 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1139  prolyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0918  prolyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4463  prolyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3343  prolyl-tRNA synthetase  23.94 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>