More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3199 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2695  prolyl-tRNA synthetase  74.85 
 
 
484 aa  764    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000655749  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0777  prolyl-tRNA synthetase  74.19 
 
 
491 aa  761    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2528  prolyl-tRNA synthetase  92.49 
 
 
493 aa  949    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3199  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
493 aa  1007    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3132  prolyl-tRNA synthetase  76.33 
 
 
484 aa  767    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.421139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0435  prolyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
483 aa  471  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0345  prolyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139585  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1665  prolyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
483 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2390  prolyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0830  prolyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
480 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3837  prolyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00668476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4863  prolyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
476 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0373  prolyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
476 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0440  prolyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
476 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0510  prolyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
476 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0370  prolyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
476 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0510  prolyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
476 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0461  prolyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
476 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0658  prolyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
480 aa  434  1e-120  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0376  prolyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
476 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0089  prolyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
477 aa  430  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1087  prolyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
476 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.723439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0382  prolyl-tRNA synthetase  44 
 
 
476 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0382  prolyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
508 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0469  prolyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
477 aa  423  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0396  prolyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
508 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.468915  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0405  prolyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
488 aa  416  9.999999999999999e-116  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0849  prolyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
481 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000760097  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0711  prolyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
481 aa  410  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05640  proline-tRNA ligase, putative  41.29 
 
 
740 aa  403  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1775  prolyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
480 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2053  prolyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
480 aa  398  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.449201 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1492  prolyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
481 aa  395  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1696  prolyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
481 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2271  prolyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
496 aa  393  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1877  prolyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
481 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103164  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84407  proline-tRNA ligase  40.78 
 
 
682 aa  394  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1587  prolyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
481 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000034459  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0277  prolyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
491 aa  392  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.273584 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0313  prolyl-tRNA synthetase  46 
 
 
478 aa  391  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000674041  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1544  prolyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
492 aa  385  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl476  prolyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
473 aa  388  1e-106  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1083  prolyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
481 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5952  prolyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
493 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000821965  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4939  prolyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
492 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580893  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0318  prolyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
474 aa  381  1e-104  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.237485  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01055  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
492 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0570  prolyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
497 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267387  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8092  prolyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
480 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19561  predicted protein  40.64 
 
 
524 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000000000368339  normal  0.864068 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2910  prolyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
490 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104105  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2310  prolyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
490 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0217  prolyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
491 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000503447  normal  0.017665 
 
 
-
 
NC_002950  PG0962  prolyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
493 aa  372  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2058  prolyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
508 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18002  predicted protein  43.48 
 
 
448 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938893  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0024  prolyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
510 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23547  predicted protein  43.78 
 
 
479 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.034898  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf031  prolyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
476 aa  365  1e-99  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2485  prolyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
480 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0863  prolyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
477 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3228  prolyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
491 aa  360  3e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.64525  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0039  prolyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
508 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0026  prolyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
510 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02150  prolyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G16010)  42.19 
 
 
594 aa  353  5e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0034  prolyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
506 aa  352  5.9999999999999994e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.599841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4267  prolyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
468 aa  344  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.975115  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0728  prolyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
465 aa  343  4e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.102661  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43097  predicted protein  39.6 
 
 
671 aa  341  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0817  prolyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0348  prolyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
471 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1303  prolyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1192  prolyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0179  prolyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
480 aa  334  3e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2180  prolyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
468 aa  323  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1640  prolyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
478 aa  320  5e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1230  prolyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
527 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0190  prolyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
478 aa  312  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.15585  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1972  prolyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
481 aa  311  2e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1386  prolyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.399979  normal  0.968589 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0487  prolyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
472 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1963  prolyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.914598 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1139  prolyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1950  prolyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
515 aa  304  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1921  prolyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 
480 aa  302  9e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1366  prolyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
487 aa  299  7e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0822  prolyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
488 aa  298  1e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62191  normal  0.0638308 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1092  prolyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
487 aa  295  9e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0803  prolyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
488 aa  295  1e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138093  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0234  prolyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
456 aa  293  5e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2042  prolyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
477 aa  293  7e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1635  prolyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
481 aa  288  1e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1723  prolyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
460 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.612812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0945  prolyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
479 aa  288  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258723  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1574  prolyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
461 aa  286  7e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0880  prolyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
460 aa  285  9e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0188  prolyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
460 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
587 aa  93.6  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
573 aa  93.6  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
573 aa  91.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>