More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0039 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0026  prolyl-tRNA synthetase  98.22 
 
 
510 aa  1028    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0039  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
508 aa  1045    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0024  prolyl-tRNA synthetase  95.46 
 
 
510 aa  1003    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2058  prolyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 
508 aa  660    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0034  prolyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 
506 aa  604  1.0000000000000001e-171  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.599841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0217  prolyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 
491 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000503447  normal  0.017665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2310  prolyl-tRNA synthetase  56.61 
 
 
490 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317446 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2271  prolyl-tRNA synthetase  55.49 
 
 
496 aa  550  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4939  prolyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 
492 aa  535  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580893  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01055  prolyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 
492 aa  528  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1544  prolyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 
492 aa  530  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0277  prolyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
491 aa  531  1e-149  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.273584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2910  prolyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 
490 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104105  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_002950  PG0962  prolyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
493 aa  524  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3228  prolyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
491 aa  524  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.64525  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5952  prolyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 
493 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000821965  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1587  prolyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 
481 aa  507  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000034459  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0849  prolyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
481 aa  502  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000760097  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1230  prolyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 
527 aa  504  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1775  prolyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 
480 aa  499  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1950  prolyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 
515 aa  498  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2053  prolyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
480 aa  498  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.449201 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1083  prolyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
481 aa  495  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0711  prolyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
481 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1696  prolyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
481 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1877  prolyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
481 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103164  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1492  prolyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 
481 aa  489  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0313  prolyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
478 aa  478  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000674041  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0863  prolyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 
477 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0830  prolyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
480 aa  459  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0469  prolyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
477 aa  458  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8092  prolyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
480 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0089  prolyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 
477 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2485  prolyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0435  prolyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1665  prolyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43097  predicted protein  46.48 
 
 
671 aa  443  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0373  prolyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
476 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0370  prolyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
476 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0440  prolyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
476 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0461  prolyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
476 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0570  prolyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
497 aa  436  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267387  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2390  prolyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
483 aa  435  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0510  prolyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
476 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0510  prolyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
476 aa  435  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4863  prolyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
476 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0405  prolyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
488 aa  433  1e-120  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0345  prolyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
478 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0382  prolyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
476 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0376  prolyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 
476 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0382  prolyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
508 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0396  prolyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
508 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.468915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3837  prolyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
477 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00668476  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18002  predicted protein  47.91 
 
 
448 aa  405  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938893  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1087  prolyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
476 aa  402  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.723439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0348  prolyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
471 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl476  prolyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
473 aa  376  1e-103  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4267  prolyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 
468 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.975115  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0658  prolyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
480 aa  375  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0318  prolyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 
474 aa  372  1e-101  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.237485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2180  prolyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
468 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1192  prolyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 
468 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf031  prolyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 
476 aa  363  4e-99  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3199  prolyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
493 aa  359  6e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1303  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3132  prolyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
484 aa  348  1e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.421139 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2528  prolyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
493 aa  344  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0777  prolyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
491 aa  340  2e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19561  predicted protein  38.18 
 
 
524 aa  334  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000000000368339  normal  0.864068 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2695  prolyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
484 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000655749  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23547  predicted protein  39.92 
 
 
479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.034898  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84407  proline-tRNA ligase  36.47 
 
 
682 aa  313  2.9999999999999996e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05640  proline-tRNA ligase, putative  39.39 
 
 
740 aa  310  4e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02150  prolyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G16010)  40.05 
 
 
594 aa  309  8e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0487  prolyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
472 aa  301  2e-80  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0728  prolyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 
465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.102661  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0190  prolyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
478 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.15585  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0179  prolyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 
480 aa  270  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0817  prolyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
482 aa  259  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0234  prolyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
456 aa  251  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1640  prolyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
478 aa  247  3e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1921  prolyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 
480 aa  245  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1574  prolyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 
461 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1386  prolyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 
477 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.399979  normal  0.968589 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1972  prolyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
481 aa  242  1e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1963  prolyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
478 aa  241  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.914598 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1723  prolyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
460 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.612812 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0822  prolyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
488 aa  240  4e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62191  normal  0.0638308 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0880  prolyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 
460 aa  239  8e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.276664  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1366  prolyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 
487 aa  239  1e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1139  prolyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 
478 aa  239  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0803  prolyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
488 aa  238  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138093  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0188  prolyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 
460 aa  237  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2042  prolyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
477 aa  236  6e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0945  prolyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
479 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258723  normal  0.604975 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1635  prolyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 
481 aa  227  4e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1092  prolyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
487 aa  226  9e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 
573 aa  65.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 
575 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 
577 aa  65.1  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>