More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23547 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_23547  predicted protein  100 
 
 
479 aa  998    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.034898  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19561  predicted protein  57.47 
 
 
524 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000000000368339  normal  0.864068 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05640  proline-tRNA ligase, putative  55.53 
 
 
740 aa  552  1e-156  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84407  proline-tRNA ligase  54.53 
 
 
682 aa  533  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02150  prolyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G16010)  54.03 
 
 
594 aa  511  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0830  prolyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 
480 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0435  prolyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
483 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0461  prolyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
476 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0373  prolyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
476 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0370  prolyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
476 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4863  prolyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
476 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0440  prolyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
476 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0510  prolyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
476 aa  385  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0510  prolyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
476 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1665  prolyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
483 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2053  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
480 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.449201 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0777  prolyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
491 aa  381  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5952  prolyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
493 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000821965  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1775  prolyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
480 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0376  prolyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
476 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0345  prolyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
478 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0382  prolyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
476 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0658  prolyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
480 aa  375  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2310  prolyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
490 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317446 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0382  prolyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
508 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0396  prolyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
508 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.468915  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2528  prolyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
493 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2271  prolyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
496 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3837  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
477 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00668476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8092  prolyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
480 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3132  prolyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
484 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.421139 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1696  prolyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
481 aa  368  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3199  prolyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
493 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1587  prolyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
481 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000034459  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2390  prolyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
483 aa  363  4e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0089  prolyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
477 aa  361  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0849  prolyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
481 aa  360  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000760097  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1492  prolyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
481 aa  359  5e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0711  prolyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
481 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0277  prolyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
491 aa  356  5.999999999999999e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.273584 
 
 
-
 
NC_002950  PG0962  prolyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
493 aa  354  2e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1087  prolyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
476 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.723439  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2910  prolyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 
490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104105  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0469  prolyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
477 aa  353  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1877  prolyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
481 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4939  prolyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
492 aa  351  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580893  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43097  predicted protein  41.07 
 
 
671 aa  351  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0217  prolyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
491 aa  351  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000503447  normal  0.017665 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0405  prolyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 
488 aa  350  2e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18002  predicted protein  41.89 
 
 
448 aa  350  2e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938893  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0863  prolyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
477 aa  348  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1083  prolyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
481 aa  347  4e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01055  prolyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
492 aa  344  2e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1544  prolyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
492 aa  342  5.999999999999999e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl476  prolyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
473 aa  342  1e-92  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2485  prolyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
480 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2695  prolyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000655749  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0313  prolyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
478 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000674041  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0318  prolyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
474 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.237485  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3228  prolyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
491 aa  334  3e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.64525  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0024  prolyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
510 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0570  prolyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
497 aa  329  7e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267387  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0034  prolyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
506 aa  328  2.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.599841 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf031  prolyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
476 aa  323  3e-87  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0039  prolyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0026  prolyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
510 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1192  prolyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
468 aa  318  9e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1303  prolyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
468 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2058  prolyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
508 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4267  prolyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.975115  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2180  prolyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
468 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0348  prolyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
471 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1230  prolyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
527 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0179  prolyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
480 aa  298  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1950  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
515 aa  296  8e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0817  prolyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
482 aa  291  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0190  prolyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
478 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.15585  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0728  prolyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
465 aa  278  2e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.102661  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1723  prolyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
460 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.612812 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1574  prolyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 
461 aa  265  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0880  prolyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
460 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0188  prolyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
460 aa  264  3e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1139  prolyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
478 aa  263  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1386  prolyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
477 aa  262  8e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.399979  normal  0.968589 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1366  prolyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 
487 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0822  prolyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
488 aa  262  1e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62191  normal  0.0638308 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0487  prolyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 
472 aa  259  9e-68  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1972  prolyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
481 aa  258  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0234  prolyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
456 aa  256  8e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0803  prolyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138093  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0945  prolyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
479 aa  253  6e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258723  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2042  prolyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
477 aa  253  7e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1921  prolyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 
480 aa  250  4e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1640  prolyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 
478 aa  250  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1963  prolyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 
478 aa  249  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.914598 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1092  prolyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 
487 aa  248  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1635  prolyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
481 aa  246  8e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 
570 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1371  prolyl-tRNA synthetase  22.69 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 
568 aa  73.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>