142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1308 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  818    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  33.08 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  31.94 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  31.54 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  32.49 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  31.58 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  30.56 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  31.64 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  27.72 
 
 		 378 aa  139  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  28.84 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  28.09 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  30.89 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  29.28 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  28.95 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  29.9 
 
 		 379 aa  127  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  27.72 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  32.11 
 
 		 451 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  29.57 
 
 		 382 aa  120  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  27.56 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  31.15 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  31.59 
 
 		 376 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  28.81 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  28.98 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  26.34 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  30.94 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  28.78 
 
 		 319 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  28.78 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  28.18 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  30.5 
 
 		 378 aa  93.2  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  28.49 
 
 		 371 aa  92.8  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  25.88 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  29.97 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  27.24 
 
 		 315 aa  86.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  27.49 
 
 		 318 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  29.55 
 
 		 261 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  29.55 
 
 		 261 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  27.17 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  32.28 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  26.53 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  25.7 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.2 
 
 		 618 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  27.81 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  23.08 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  27.31 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  48 
 
 		 591 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  27.07 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  50 
 
 		 591 aa  56.6  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  22.53 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  29.73 
 
 		 303 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  23.53 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  30.54 
 
 		 318 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  27.04 
 
 		 328 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  42 
 
 		 593 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  26.94 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0166  NADH dehydrogenase (quinone)  42.55 
 
 		 612 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  46 
 
 		 590 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  25.77 
 
 		 358 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  23.91 
 
 		 307 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2086  ferredoxin  28.17 
 
 		 128 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  28.02 
 
 		 301 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.75 
 
 		 436 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 		 603 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1358  ferredoxin  28.7 
 
 		 176 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  44.9 
 
 		 593 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.67 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  22.75 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1265  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 58 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.755601  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 		 593 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1768  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  35.19 
 
 		 83 aa  47.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000010158 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.21 
 
 		 126 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199515  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  35.42 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05370  4Fe-4S protein  27.4 
 
 		 313 aa  47.8  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.716357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.83 
 
 		 443 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1440  ferridoxin  38.18 
 
 		 140 aa  46.6  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.760921  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1431  NIL domain protein  40 
 
 		 133 aa  46.6  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000290887  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0137  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.54 
 
 		 127 aa  46.6  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0310  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.48 
 
 		 128 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3578  adenylylsulfate reductase, beta subunit  36.51 
 
 		 146 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000448806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  26.92 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3941  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.84 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000105876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1897  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 75 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1709  pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase, gamma subunit  32.47 
 
 		 339 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0681484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17450  glycyl-radical enzyme activator family protein  32.73 
 
 		 311 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.478583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  26.49 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  39.13 
 
 		 635 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3090  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.18 
 
 		 545 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.595206  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0020  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 128 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 		 636 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.87 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  37.74 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 131 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.188784  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.12 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0870  ferredoxin  31.76 
 
 		 170 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00207801 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.09 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0370155  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 		 526 aa  45.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0910  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 135 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00418266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1886  adenylylsulfate reductase, beta subunit  36.51 
 
 		 145 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  23.99 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.67 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0733  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  38.18 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>