35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1886 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1886  adenylylsulfate reductase, beta subunit  100 
 
 
145 aa  301  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1081  adenylylsulfate reductase, beta subunit  76.39 
 
 
147 aa  235  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0636  adenylylsulfate reductase, beta subunit  77.86 
 
 
147 aa  233  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3578  adenylylsulfate reductase, beta subunit  75.89 
 
 
146 aa  227  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000448806  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1047  adenylylsulfate reductase, beta subunit  77.37 
 
 
147 aa  221  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0187678  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0997  adenylylsulfate reductase, beta subunit  75.89 
 
 
144 aa  192  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000160425  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1838  adenylylsulfate reductase, beta subunit  72.97 
 
 
140 aa  184  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0138336  normal  0.023497 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1586  adenylylsulfate reductase subunit beta  69.23 
 
 
140 aa  184  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00926364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3197  adenylylsulfate reductase, beta subunit  62.5 
 
 
162 aa  183  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000312858  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0040  adenylylsulfate reductase, beta subunit  71.17 
 
 
140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2130  adenylylsulfate reductase, beta subunit  64.71 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.925917  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2892  adenylylsulfate reductase, beta subunit  61.97 
 
 
167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.409396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1109  adenylylsulfate reductase subunit beta  62.69 
 
 
162 aa  179  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000257152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2137  adenylylsulfate reductase, beta subunit  62.5 
 
 
167 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0873  adenylylsulfate reductase, beta subunit  67.48 
 
 
161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1967  adenylylsulfate reductase, beta subunit  67.52 
 
 
167 aa  176  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0419652 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  41.13 
 
 
159 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  40.85 
 
 
160 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0272  adenylylsulfate reductase, beta subunit  45.05 
 
 
161 aa  101  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000000553885  hitchhiker  0.000000190129 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1429  adenylylsulfate reductase, beta subunit  40.54 
 
 
160 aa  101  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0667078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  40.14 
 
 
160 aa  100  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1234  adenylylsulfate reductase, beta subunit  39.01 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.480788  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.51 
 
 
107 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.78 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000841156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0925  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.64 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1709  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  35.24 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.48 
 
 
107 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  36.51 
 
 
396 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.61 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.68 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  30.16 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  38.46 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814234  normal  0.164928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34920  putative ferredoxin  40.98 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025951  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0206  ferredoxin, 4Fe-4S  39.68 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.623695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>