71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1208 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 424 aa  875    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  43.16 
 
 		 418 aa  285  8e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  38.27 
 
 		 453 aa  255  9e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  38.68 
 
 		 449 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  38.84 
 
 		 449 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  38.84 
 
 		 449 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  38.1 
 
 		 437 aa  249  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.34 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  36.25 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  35.19 
 
 		 429 aa  229  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  37.19 
 
 		 441 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  34.96 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  32.45 
 
 		 430 aa  207  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  34.04 
 
 		 438 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  34.04 
 
 		 438 aa  196  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  33.58 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  33.95 
 
 		 438 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  32.93 
 
 		 452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  33.16 
 
 		 443 aa  182  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  31.83 
 
 		 439 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  32.16 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  30.79 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  31.7 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  30.89 
 
 		 445 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  29.59 
 
 		 446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  31.81 
 
 		 453 aa  163  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  30.19 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  31.29 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  31.52 
 
 		 434 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  29.62 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  31.5 
 
 		 455 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  32.05 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  30 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  31.45 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  31.89 
 
 		 447 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  28.87 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  28.71 
 
 		 446 aa  143  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  28.44 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  28.89 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 453 aa  133  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  25.46 
 
 		 467 aa  91.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  26.62 
 
 		 456 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  31.18 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0975  homoserine dehydrogenase  27.16 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000487265  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  30.67 
 
 		 452 aa  50.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  26.2 
 
 		 440 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  23.94 
 
 		 431 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  23.94 
 
 		 431 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  23.94 
 
 		 431 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  23.94 
 
 		 431 aa  46.6  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  24.64 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  25.19 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  23.94 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  23.94 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  24.09 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  23.94 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.56 
 
 		 455 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  23.94 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4076  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  25.6 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.19851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  26.32 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  24.14 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  24.11 
 
 		 431 aa  44.3  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  26.21 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  24.14 
 
 		 431 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 		 356 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  27.74 
 
 		 438 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  23.24 
 
 		 431 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  26.67 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  23.91 
 
 		 431 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>