More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0543 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  100 
 
 
241 aa  490  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  41.56 
 
 
249 aa  178  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  37.56 
 
 
251 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  34.84 
 
 
260 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  34.65 
 
 
246 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  35.29 
 
 
249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  35.29 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  37.34 
 
 
251 aa  162  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  35.29 
 
 
248 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
256 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  36.77 
 
 
255 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  34.62 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  34.76 
 
 
256 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  37.88 
 
 
211 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  34.19 
 
 
249 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  32.86 
 
 
240 aa  148  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  31.22 
 
 
241 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  32.48 
 
 
258 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  40.27 
 
 
275 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  33.03 
 
 
246 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  34.07 
 
 
240 aa  141  7e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  33.03 
 
 
246 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  33.03 
 
 
246 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  33.03 
 
 
246 aa  141  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  33.03 
 
 
246 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  32.58 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  32.58 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  34.47 
 
 
268 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  33.03 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  31.9 
 
 
246 aa  138  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  34.23 
 
 
220 aa  138  6e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  32.58 
 
 
246 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  31.74 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  30.6 
 
 
241 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  30.6 
 
 
241 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  30.77 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  36.28 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  31.78 
 
 
251 aa  133  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  35.85 
 
 
268 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  34.04 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  32.22 
 
 
245 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 
248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  28.95 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  31.98 
 
 
254 aa  125  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  27.59 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  29.63 
 
 
228 aa  118  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  29.13 
 
 
330 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  28.09 
 
 
338 aa  116  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  28.39 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  27.95 
 
 
235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  31.2 
 
 
266 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  23.92 
 
 
263 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  34.18 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  25.73 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  31.95 
 
 
260 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  28.9 
 
 
233 aa  104  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  33.48 
 
 
398 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  34.45 
 
 
250 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  31.17 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  30.43 
 
 
253 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  26.42 
 
 
233 aa  98.2  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  30.37 
 
 
259 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  28.11 
 
 
233 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  31.44 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  28.31 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  25.56 
 
 
230 aa  96.3  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  29.38 
 
 
223 aa  95.9  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  30.54 
 
 
262 aa  95.1  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  32.07 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  27.56 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  35.17 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  30.29 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  28.31 
 
 
233 aa  94  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  29.74 
 
 
271 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  33.48 
 
 
257 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  24.43 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  32.35 
 
 
252 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  30.33 
 
 
272 aa  89.4  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  24.32 
 
 
231 aa  89.7  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  30.36 
 
 
239 aa  89  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  31.71 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  28.7 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  30.63 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  31.62 
 
 
260 aa  85.1  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  38.52 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  28.57 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  28.44 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  23.21 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  24.52 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  24.19 
 
 
240 aa  79  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  32.63 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  25.26 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  28.86 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  33.63 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  30.05 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  29.76 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0330  O-methyltransferase-like protein  25.37 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  25.26 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  23.5 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  26.99 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>