More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3580 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  100 
 
 		 124 aa  253  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  80.49 
 
 		 125 aa  211  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  80.83 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  79.34 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  79.17 
 
 		 123 aa  197  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  69.42 
 
 		 144 aa  193  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  69.42 
 
 		 142 aa  193  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  73.33 
 
 		 138 aa  190  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  74.17 
 
 		 127 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  72.27 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  70.83 
 
 		 143 aa  184  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  73.55 
 
 		 153 aa  183  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  70 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  71.07 
 
 		 146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  70.94 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  67.5 
 
 		 131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  67.23 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  66.67 
 
 		 144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  64.75 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  62.3 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  66.67 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  70.34 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  65.81 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  71.67 
 
 		 125 aa  165  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  65.52 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  58.33 
 
 		 139 aa  156  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  58.82 
 
 		 291 aa  154  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  58.82 
 
 		 291 aa  154  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  59.2 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  63.33 
 
 		 129 aa  150  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  54.03 
 
 		 312 aa  147  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.55 
 
 		 154 aa  146  8e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.62 
 
 		 298 aa  146  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.41 
 
 		 281 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  58.87 
 
 		 182 aa  144  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.46 
 
 		 284 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.46 
 
 		 284 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.46 
 
 		 286 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  52.54 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  55 
 
 		 284 aa  139  9e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  56.1 
 
 		 207 aa  139  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 		 277 aa  137  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  54.76 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.14 
 
 		 283 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  52.07 
 
 		 211 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  55.56 
 
 		 128 aa  136  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  54.47 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.42 
 
 		 344 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.66 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.47 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  53.66 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  53.97 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  56.03 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.03 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  52.85 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  53.66 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  53.66 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  52.85 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  53.66 
 
 		 133 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.03 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.85 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  52.85 
 
 		 135 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.93 
 
 		 280 aa  134  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  52.03 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  52.03 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  52.85 
 
 		 133 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  51.67 
 
 		 127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.19 
 
 		 329 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  52.03 
 
 		 128 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  52.03 
 
 		 128 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  53.17 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.57 
 
 		 278 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.94 
 
 		 277 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  52.03 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  52.85 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  56.67 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  52.42 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  52.03 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  52.03 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  52.03 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  51.22 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  52.03 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  52.03 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  52.03 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2732  scaffold protein  52.03 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  52.03 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.58 
 
 		 309 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  52.03 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  52.03 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  52.03 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  50.41 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.14 
 
 		 281 aa  131  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  52.03 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_822  NifU domain protein  51.67 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  53.66 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  54.47 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  53.17 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  53.17 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>