More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2246 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0359  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  63 
 
 
635 aa  811    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.101068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1386  ABC transporter related  61.65 
 
 
629 aa  794    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000285289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2246  ABC transporter related  100 
 
 
650 aa  1335    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0885  ABC transporter related  53.97 
 
 
638 aa  685    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0703423 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1122  ABC transporter, ATP-binding protein  50.08 
 
 
683 aa  652    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.642926 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1238  ABC transporter related  58.97 
 
 
631 aa  753    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1257  hypothetical protein  62.17 
 
 
639 aa  772    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3148  ABC transporter related protein  58.14 
 
 
632 aa  729    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1948  multidrug ABC transporter ATPase/permease  57.32 
 
 
671 aa  780    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.720417  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0822  ABC transporter related  59.32 
 
 
640 aa  754    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0882213  hitchhiker  0.0000266707 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1736  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.17 
 
 
616 aa  617  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1222  ABC transporter related protein  53.68 
 
 
608 aa  589  1e-167  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0422  ABC transporter related  47.07 
 
 
606 aa  550  1e-155  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1365  ABC transporter related  45.25 
 
 
621 aa  545  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000419806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  45.62 
 
 
630 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  42.15 
 
 
617 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.09 
 
 
598 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  39.22 
 
 
597 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  39.22 
 
 
597 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.26 
 
 
598 aa  465  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.99 
 
 
598 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.24 
 
 
598 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  39.31 
 
 
605 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  40.78 
 
 
615 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  39.35 
 
 
607 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  39.55 
 
 
626 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  38.77 
 
 
598 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
620 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  39.15 
 
 
598 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.06 
 
 
637 aa  449  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.38 
 
 
637 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.99 
 
 
598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  38.99 
 
 
598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  38.84 
 
 
598 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  39.07 
 
 
631 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.99 
 
 
598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.46 
 
 
618 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  39.62 
 
 
618 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  39.2 
 
 
625 aa  445  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  37.9 
 
 
636 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  37.48 
 
 
671 aa  440  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  41.36 
 
 
620 aa  440  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  39.26 
 
 
613 aa  437  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  39.5 
 
 
628 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
618 aa  434  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  38.28 
 
 
640 aa  433  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.32 
 
 
677 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.85 
 
 
608 aa  429  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.14 
 
 
589 aa  425  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.29 
 
 
632 aa  423  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  36.14 
 
 
628 aa  419  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  37.9 
 
 
631 aa  422  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  37.82 
 
 
627 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  38.2 
 
 
624 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  40.21 
 
 
582 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  41.9 
 
 
620 aa  415  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.96 
 
 
691 aa  415  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  37.4 
 
 
623 aa  413  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  38.04 
 
 
669 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  37.64 
 
 
600 aa  412  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  36.78 
 
 
666 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  37.88 
 
 
607 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  39.56 
 
 
672 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  39.63 
 
 
672 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.61 
 
 
721 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  38.53 
 
 
661 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  38.85 
 
 
606 aa  405  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  37.72 
 
 
811 aa  401  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.62 
 
 
593 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.2 
 
 
670 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  37.66 
 
 
765 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  36.93 
 
 
663 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  39.48 
 
 
649 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  39.31 
 
 
653 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  37.65 
 
 
691 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  35.1 
 
 
695 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  37.5 
 
 
634 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  34.66 
 
 
584 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  36.25 
 
 
613 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  38.06 
 
 
631 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.43 
 
 
615 aa  391  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.07 
 
 
595 aa  390  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  37.92 
 
 
652 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  38.06 
 
 
631 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  37.7 
 
 
631 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  37.72 
 
 
663 aa  391  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.94 
 
 
702 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  35.28 
 
 
619 aa  388  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  34.23 
 
 
680 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  37.9 
 
 
665 aa  389  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  35.35 
 
 
598 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  35.94 
 
 
625 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  35.53 
 
 
597 aa  385  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  35.84 
 
 
586 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  38.87 
 
 
701 aa  385  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  39.49 
 
 
625 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  37.54 
 
 
619 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1712  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.55 
 
 
575 aa  380  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  36.42 
 
 
592 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  39.63 
 
 
642 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>