More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_3098 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_3098  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 352 aa  704    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3390  hypothetical protein  47.94 
 
 		 346 aa  292  5e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.305361  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3452  transcriptional regulator, LacI family  41.93 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3382  transcriptional regulator, LacI family  39.42 
 
 		 333 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.22035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1295  transcriptional regulator, LacI family  37.1 
 
 		 345 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4981  transcriptional regulator, LacI family  48.15 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00303517  hitchhiker  0.00602163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2723  transcriptional regulator, LacI family  37.86 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.858464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2515  transcriptional regulator, LacI family  36.78 
 
 		 357 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185479  hitchhiker  0.0043298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 		 374 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4363  LacI family transcription regulator  30.98 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000162438  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  31.45 
 
 		 360 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  28.74 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  30.92 
 
 		 346 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1756  LacI family transcription regulator  30.51 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  29.13 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7045  LacI family transcription regulator  30.75 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  27.33 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  24.84 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  30.61 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3340  LacI family transcription regulator  30.18 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3632  transcriptional regulator, LacI family  24.6 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  31.27 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  30.63 
 
 		 384 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 361 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1460  transcriptional regulator, LacI family  30.66 
 
 		 356 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0141269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  29.5 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  27.97 
 
 		 348 aa  96.3  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0550  LacI family transcription regulator  26.69 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  30.35 
 
 		 342 aa  96.3  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2753  transcriptional regulator, LacI family  30.19 
 
 		 344 aa  95.9  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 473 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2083  LacI family transcription regulator  28.62 
 
 		 342 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  27.16 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0285  alanine racemase  27.89 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1419  transcriptional regulator, LacI family  30.26 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.933801  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  27.91 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  29.25 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  25.08 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1965  transcriptional regulator, LacI family  26.42 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  28.21 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  30.6 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  26.14 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  25.47 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1078  transcriptional regulator, LacI family  29.84 
 
 		 334 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  28.75 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3331  regulatory protein LacI  29.84 
 
 		 334 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 337 aa  93.6  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1601  alanine racemase  27.3 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.520299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2401  LacI family transcription regulator  30.28 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  28.79 
 
 		 333 aa  92.8  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  26.11 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3686  LacI family transcription regulator  32.04 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  29.43 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3421  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.04 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  28.71 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1802  LacI family transcription regulator  25.79 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1553  transcriptional regulator, LacI family  25.79 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1790  transcription regulator protein  29.97 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.678671  normal  0.041815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  24.6 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  23.75 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  23.99 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1531  LacI family transcription regulator  25.47 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  31.27 
 
 		 335 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  31.12 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  26.67 
 
 		 340 aa  90.5  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6160  transcriptional regulator, LacI family  28.39 
 
 		 340 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  28.01 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  28.95 
 
 		 368 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01297  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.47 
 
 		 332 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2326  transcriptional regulator, LacI family  25.47 
 
 		 332 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000810119  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1486  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.479144 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01308  hypothetical protein  25.47 
 
 		 332 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0638482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2305  LacI family transcription regulator  25.47 
 
 		 332 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00729932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  30.22 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  29.11 
 
 		 325 aa  90.1  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1435  LacI family transcription regulator  25.47 
 
 		 332 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  27.53 
 
 		 337 aa  89.7  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2155  LacI family transcription regulator  25.24 
 
 		 336 aa  89.7  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 350 aa  89.7  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2142  transcriptional regulator, LacI family  24.09 
 
 		 341 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3140  transcriptional regulator, LacI family  29.1 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.636128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  26.56 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  26.83 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3453  LacI family transcription regulator  32.36 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.286826 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.47 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  25.23 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  27.27 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0617  transcriptional regulator, LacI family  28.93 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  29.08 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0495  LacI family transcription regulator  29.81 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  23.91 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.08 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>