47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2941 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  100 
 
 		 92 aa  183  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  43.37 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  40.45 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  43.04 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  44.59 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  41.86 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  44.59 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  45.57 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  44.59 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  36.9 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  37.93 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  36.36 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  42.11 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  43.48 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  36.71 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  36.84 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  40.26 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  37.65 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  34.62 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  34.62 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  41.89 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  39.51 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  36.84 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  36.84 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  36.84 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  36.84 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  39.24 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  35.14 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  35.14 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  37.65 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2043  hypothetical protein  37.66 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0191203  hitchhiker  0.00751766 
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  35.29 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  36.62 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  35.21 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0915  hypothetical protein  37.65 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0663425  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0764  hypothetical protein  37.65 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4306  Protein of unknown function DUF1778  35.9 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.956643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  30.26 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  36.76 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  34.94 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2943  hypothetical protein  35.94 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.197076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  28.38 
 
 		 92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  36.05 
 
 		 99 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  32.39 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1272  hypothetical protein  60 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>