More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2202 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  297  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  43.57 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  48.89 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 343 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 343 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 342 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 343 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  40.35 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  54.55 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  53.12 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  35.56 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  50 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  40.18 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  48 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  38.89 
 
 		 252 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  37.04 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  33.88 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  33.88 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  33.88 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  33.06 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 268 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  47.89 
 
 		 251 aa  64.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  47.62 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.84 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 630 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 630 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 659 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  36.94 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  32.79 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  46.48 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  47.62 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  31.97 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  46.03 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  53.62 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 253 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 257 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  29.79 
 
 		 253 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 258 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 340 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 251 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  35.9 
 
 		 278 aa  60.8  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  49.21 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>