More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2149 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2149  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  435  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0195  two component transcriptional regulator  65.14 
 
 		 222 aa  291  6e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2805  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.17 
 
 		 224 aa  255  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.26 
 
 		 224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.602411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.87 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.41 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.36 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 231 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3722  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.63 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 237 aa  159  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  42.2 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  38.5 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.28 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.47 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.4 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  42.4 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.28 
 
 		 225 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.74 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.74 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.74 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1510  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.29 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  42.47 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.28 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0596  response regulator receiver domain protein  37.39 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.47 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  39.22 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  40.18 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1376  DNA-binding response regulator IrlR  40.83 
 
 		 229 aa  155  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4632  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.920872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  40.83 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  40.83 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1055  transcriptional regulatory protein YedW  41.1 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1028  DNA-binding response regulator IrlR  40.83 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0282692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  42.73 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0030  DNA-binding response regulator IrlR  40.83 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1160  transcriptional regulatory protein YedW  41.1 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.728212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1439  transcriptional activator IrlR  40.83 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.66 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  40.83 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  42.73 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  40.83 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1191  transcriptional regulatory protein YedW  41.1 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.91 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  43.38 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  40.37 
 
 		 229 aa  154  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.01 
 
 		 224 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  43.24 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  40.18 
 
 		 224 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  154  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  36.99 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.83 
 
 		 227 aa  154  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  41.7 
 
 		 220 aa  154  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0185  DNA-binding response regulator CreB  41.52 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>