56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1582 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  100 
 
 		 357 aa  715    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  43.24 
 
 		 350 aa  243  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  43.15 
 
 		 349 aa  239  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  40.17 
 
 		 352 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  40.38 
 
 		 360 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0171  putative RNA methylase  38.13 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  hitchhiker  0.00204483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15560  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  34.02 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  30.5 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  32.28 
 
 		 359 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  28.57 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  27.79 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  36 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  24.38 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  32.89 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  29.71 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  32.33 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  29.08 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  29.1 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1302  putative RNA methylase  25.83 
 
 		 510 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  34.4 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 263 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  31.13 
 
 		 330 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  28.57 
 
 		 322 aa  50.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  30.58 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  32.94 
 
 		 255 aa  47.4  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1546  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35 
 
 		 310 aa  46.2  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  33.03 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  28.04 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2739  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.71 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0822  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.77 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  29.87 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  27.15 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.01 
 
 		 243 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2467  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.466168  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0218  putative RNA methylase  27.27 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000547055 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  24.39 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 286 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2594  modification methylase, HemK family  34.62 
 
 		 310 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  31.54 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.11 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  33.78 
 
 		 280 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  30.56 
 
 		 258 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2156  ribosomal L11 methyltransferase  34.21 
 
 		 296 aa  43.5  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  35.14 
 
 		 345 aa  43.1  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  33.11 
 
 		 329 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  29.29 
 
 		 310 aa  43.1  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.79 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1435  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.67 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.234011  normal  0.0952317 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  26.49 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  30.97 
 
 		 253 aa  42.7  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>