More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1440 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1440  signal recognition particle protein  100 
 
 		 450 aa  896    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.627334  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2279  signal recognition particle protein  64.1 
 
 		 435 aa  562  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000146943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1006  signal recognition particle protein  62.5 
 
 		 434 aa  558  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0974  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  52.51 
 
 		 448 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.66 
 
 		 446 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  51.33 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  51.79 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  50.34 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  52.42 
 
 		 446 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  53.32 
 
 		 469 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  52.33 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  51.64 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  51.61 
 
 		 444 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.21 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  53.16 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  51.61 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  51.06 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  52.34 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  52.34 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  52.34 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  52.34 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  52.34 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  49.12 
 
 		 518 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  52.34 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  51.17 
 
 		 455 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2134  signal recognition particle protein  51.07 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  51.64 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  50.7 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  50.7 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  51.74 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  50 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.39 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  48.4 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  50.68 
 
 		 444 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.76 
 
 		 447 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  49.43 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  47.11 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  49.07 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  49.53 
 
 		 433 aa  398  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2154  signal recognition particle protein  51.45 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.995378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  48.87 
 
 		 449 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 453 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3275  signal recognition particle protein  50.43 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0976333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.58 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  48.3 
 
 		 515 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  48.12 
 
 		 449 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  45.98 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  45.48 
 
 		 440 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.29 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  47.91 
 
 		 443 aa  388  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  48.06 
 
 		 515 aa  389  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2887  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 522 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.53 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  48.98 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  49.21 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  46.71 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  46.74 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.91 
 
 		 481 aa  383  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  51.05 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1053  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.3 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  46.9 
 
 		 444 aa  385  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1404  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.4 
 
 		 491 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294047  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  48.04 
 
 		 512 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  49.41 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  49.43 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  46 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  48.94 
 
 		 493 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  48.24 
 
 		 492 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2714  signal recognition particle protein  49.3 
 
 		 505 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  0.0233143 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  49.41 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4158  signal recognition particle protein  49.67 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23319  normal  0.485937 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  49.07 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  45.21 
 
 		 441 aa  378  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.69 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  49.41 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  49.18 
 
 		 453 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3618  signal recognition particle protein  49.44 
 
 		 521 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0128303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1184  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.73 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  49.41 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1066  signal recognition particle protein  49.67 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3683  signal recognition particle protein  48.99 
 
 		 526 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2643  signal recognition particle protein  46.79 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 453 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2921  signal recognition particle protein  49.07 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000450795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  48.25 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  49.41 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  49.18 
 
 		 453 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  49.18 
 
 		 453 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  47.59 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3018  signal recognition particle protein  48.84 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000039159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  49.18 
 
 		 453 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>