230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3947 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3947  aminopeptidase precursor  100 
 
 		 666 aa  1387    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  56.99 
 
 		 900 aa  777    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4942  putative aminopeptidase precursor  68.7 
 
 		 689 aa  971    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3437  aminopeptidase N-like protein  54.08 
 
 		 756 aa  711    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0395  peptidase  49.92 
 
 		 638 aa  589  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  44.8 
 
 		 668 aa  557  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2017  peptidase  44.74 
 
 		 732 aa  548  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0655  putative aminopeptidase precursor  44.04 
 
 		 655 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0677  putative aminopeptidase precursor  43.72 
 
 		 655 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.796434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0685  putative aminopeptidase precursor  43.72 
 
 		 655 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  43.56 
 
 		 655 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0411  putative aminopeptidase  39.17 
 
 		 792 aa  391  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07610  Zn-dependent aminopeptidase  37.54 
 
 		 770 aa  373  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4270  putative Zn-dependent aminopeptidase  37.46 
 
 		 816 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5082  Zn-dependent aminopeptidase  39.75 
 
 		 792 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.546478 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1773  aminopeptidase N-like protein  37.71 
 
 		 745 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0409  putative Zn-dependent aminopeptidase  37.64 
 
 		 815 aa  365  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0694511  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2099  putative Zn-dependent aminopeptidase  37.76 
 
 		 818 aa  363  8e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0836381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04033  putative Zn-dependent aminopeptidase  39.16 
 
 		 821 aa  360  4e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4234  putative aminopeptidase  38.25 
 
 		 793 aa  359  8e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000700491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5083  putative aminopeptidase  39.15 
 
 		 801 aa  353  5.9999999999999994e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  37.69 
 
 		 778 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1430  aminopeptidase, putative  36.26 
 
 		 811 aa  351  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0410174  hitchhiker  0.0000000588353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  37.5 
 
 		 775 aa  351  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1781  putative Zn-dependent aminopeptidase  39.42 
 
 		 838 aa  348  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488569  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  34.46 
 
 		 663 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1889  hypothetical protein  29.25 
 
 		 610 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3347  hypothetical protein  30.67 
 
 		 631 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  31.38 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  28.25 
 
 		 603 aa  219  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.43 
 
 		 620 aa  205  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.46 
 
 		 640 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.71 
 
 		 619 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4868  aminopeptidase N-like protein  27.07 
 
 		 623 aa  190  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0331081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  27.35 
 
 		 1079 aa  184  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  26.48 
 
 		 1026 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  25.12 
 
 		 628 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22 
 
 		 649 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.41 
 
 		 480 aa  107  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.79 
 
 		 482 aa  87.4  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.1 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.33 
 
 		 551 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  19.87 
 
 		 922 aa  71.2  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.79 
 
 		 835 aa  64.7  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.26 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1238  aminopeptidase N  25 
 
 		 871 aa  63.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.36 
 
 		 504 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  26.67 
 
 		 688 aa  62  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.22 
 
 		 821 aa  62  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0417  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.75 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.14 
 
 		 559 aa  61.6  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.79 
 
 		 834 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.67 
 
 		 823 aa  61.6  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  24.66 
 
 		 887 aa  61.2  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.76 
 
 		 824 aa  60.8  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.21 
 
 		 686 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  20.51 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.01 
 
 		 846 aa  58.9  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.7 
 
 		 516 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.1 
 
 		 822 aa  56.6  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.94 
 
 		 878 aa  55.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  21.4 
 
 		 877 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04276  aminopeptidase  30.43 
 
 		 670 aa  55.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2808  aminopeptidase N  24.38 
 
 		 872 aa  55.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  25.53 
 
 		 877 aa  55.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0741  leukotriene A4 hydrolase  26.14 
 
 		 671 aa  54.7  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697982  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0830  aminopeptidase N  30 
 
 		 647 aa  54.3  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  22.02 
 
 		 918 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.66 
 
 		 673 aa  53.9  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  22.02 
 
 		 877 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  22.02 
 
 		 877 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  24.47 
 
 		 877 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  24.47 
 
 		 877 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  26.54 
 
 		 858 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2482  aminopeptidase N  25.8 
 
 		 855 aa  53.9  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279976  hitchhiker  0.00729308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  21.82 
 
 		 877 aa  53.5  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.56 
 
 		 768 aa  53.5  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00936  aminopeptidase N  26.2 
 
 		 870 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00647733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2711  aminopeptidase N  26.2 
 
 		 870 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1033  aminopeptidase N  26.2 
 
 		 870 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00218696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1649  aminopeptidase N  27.27 
 
 		 888 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00465635  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00943  hypothetical protein  26.2 
 
 		 870 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00550422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2386  aminopeptidase N  27.51 
 
 		 870 aa  52.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2187  aminopeptidase N  26.2 
 
 		 870 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.739046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2457  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.56 
 
 		 642 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.982771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.31 
 
 		 845 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.88 
 
 		 823 aa  52.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1041  aminopeptidase N  26.2 
 
 		 870 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.230058  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2664  aminopeptidase N  26.2 
 
 		 870 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00436618  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1997  M1 family peptidase  29.56 
 
 		 628 aa  52.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0475  aminopeptidase N  31.25 
 
 		 864 aa  52  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.392595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2339  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.56 
 
 		 642 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.0830864 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2227  aminopeptidase N  24.01 
 
 		 853 aa  52.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.396627  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1094  aminopeptidase N  26.2 
 
 		 870 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0163604  normal  0.415463 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2267  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.93 
 
 		 642 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.45 
 
 		 860 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.56 
 
 		 905 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  23.49 
 
 		 829 aa  51.2  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3111  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.82 
 
 		 633 aa  50.8  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2556  aminopeptidase N  24.2 
 
 		 871 aa  50.8  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0655093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>