269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3491 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3491  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 110 aa  213  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.215655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4749  large conductance mechanosensitive channel protein  76.36 
 
 		 110 aa  176  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  57.69 
 
 		 138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  62.14 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  60 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  62.38 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  58.49 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  57.55 
 
 		 139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  55.77 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  57.55 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  56.07 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  55.66 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  55.66 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  55.66 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  55.66 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  56.19 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  63.27 
 
 		 133 aa  124  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  56.6 
 
 		 139 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  56.19 
 
 		 148 aa  123  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  56.73 
 
 		 141 aa  123  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  53.85 
 
 		 137 aa  123  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  54.55 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  54.72 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  54.55 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  56.48 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1256  large conductance mechanosensitive channel protein  55.45 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  60.4 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3679  large-conductance mechanosensitive channel  57.58 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  54.81 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  57.58 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.256612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3606  large-conductance mechanosensitive channel  57.58 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  54.81 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  58.59 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3714  large-conductance mechanosensitive channel  57.58 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.401904 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  54.81 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3777  large-conductance mechanosensitive channel  57.58 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  53.85 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  53.64 
 
 		 136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  53.64 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  53.64 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  53.64 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  58.18 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  53.85 
 
 		 136 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  54.46 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  52.43 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  51.4 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  61 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  61 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  61 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  60.95 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  61 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  54.46 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  61 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1330  large conductance mechanosensitive channel protein  59.6 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  49.17 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  49.17 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  59 
 
 		 133 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  59 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  51.85 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  49.17 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  60 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 134 aa  110  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  60 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  51.33 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  46.15 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  55.75 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  49.57 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  50.44 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  52.29 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1549  large-conductance mechanosensitive channel  60 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.406526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  58 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  51.85 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  58 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  53.64 
 
 		 126 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  54.63 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  46.36 
 
 		 125 aa  105  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  52.78 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  45.22 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  48.62 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  49.58 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  47.46 
 
 		 163 aa  103  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  47.46 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  51.82 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  47.75 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  52.21 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  44.64 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  47.27 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  48.72 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  49.07 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>