285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1999 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 509 aa  1055    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  54.24 
 
 		 506 aa  561  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  54.69 
 
 		 513 aa  561  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  53.51 
 
 		 512 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  54.67 
 
 		 502 aa  554  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  51.79 
 
 		 511 aa  550  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  37.35 
 
 		 533 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  37.72 
 
 		 535 aa  316  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  35.98 
 
 		 508 aa  315  9e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  36.35 
 
 		 540 aa  309  8e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  34.65 
 
 		 504 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  36.83 
 
 		 511 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  35.49 
 
 		 523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  34.12 
 
 		 504 aa  304  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 		 508 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  34.12 
 
 		 504 aa  304  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  34.53 
 
 		 516 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  35.6 
 
 		 507 aa  299  8e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  34.71 
 
 		 523 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  32.94 
 
 		 505 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  37.36 
 
 		 498 aa  294  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  34.22 
 
 		 520 aa  293  7e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  32.07 
 
 		 507 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  32.93 
 
 		 505 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1820  histidine ammonia-lyase  32.49 
 
 		 530 aa  290  6e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175616  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  34.49 
 
 		 505 aa  289  6e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  32.73 
 
 		 505 aa  289  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  32.73 
 
 		 505 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  32.53 
 
 		 505 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  32.34 
 
 		 505 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  35.1 
 
 		 517 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  32.53 
 
 		 506 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  34.92 
 
 		 505 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  34.92 
 
 		 505 aa  286  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  34.92 
 
 		 505 aa  286  7e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  32.53 
 
 		 505 aa  286  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  34.17 
 
 		 516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 		 497 aa  282  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  32.34 
 
 		 509 aa  280  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  33.54 
 
 		 519 aa  279  8e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  31.82 
 
 		 515 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  33.75 
 
 		 524 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  35.41 
 
 		 518 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  35.65 
 
 		 518 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 511 aa  277  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  32.72 
 
 		 715 aa  277  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  32.4 
 
 		 515 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  34.7 
 
 		 489 aa  273  4.0000000000000004e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  33.89 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  35.22 
 
 		 515 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  35.41 
 
 		 518 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  31.61 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  31.68 
 
 		 515 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  31.9 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  33.89 
 
 		 506 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  31.41 
 
 		 506 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  33.77 
 
 		 510 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  31.7 
 
 		 506 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  31.7 
 
 		 506 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  35.19 
 
 		 518 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  34.82 
 
 		 508 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  35.46 
 
 		 508 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  31.66 
 
 		 507 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  35.85 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  33.41 
 
 		 509 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  34.98 
 
 		 508 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  34.61 
 
 		 508 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 514 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  32.24 
 
 		 506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  32.51 
 
 		 510 aa  267  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  32.11 
 
 		 514 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 531 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  32.51 
 
 		 514 aa  266  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  33.77 
 
 		 531 aa  266  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  34.3 
 
 		 506 aa  265  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  33.41 
 
 		 519 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  30.97 
 
 		 538 aa  264  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  32.14 
 
 		 507 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  33.41 
 
 		 520 aa  263  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1932  histidine ammonia-lyase  34.93 
 
 		 520 aa  263  4e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  33.13 
 
 		 506 aa  263  4e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  31.76 
 
 		 507 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  33.61 
 
 		 513 aa  263  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  32.57 
 
 		 521 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  34.6 
 
 		 517 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  32.84 
 
 		 511 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  31.56 
 
 		 529 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  32.53 
 
 		 526 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  31.56 
 
 		 529 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  31.56 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  32.84 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  32.84 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  31.56 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  31.56 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  31.56 
 
 		 533 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  32.38 
 
 		 510 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  34.05 
 
 		 507 aa  261  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  32.57 
 
 		 521 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  32.02 
 
 		 528 aa  260  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5831  histidine ammonia-lyase  32.92 
 
 		 524 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>