128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1957 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  692    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  38.44 
 
 
345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  39.22 
 
 
345 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  39.02 
 
 
318 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 
309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  39.93 
 
 
323 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  35.74 
 
 
321 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  34.94 
 
 
316 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  34.74 
 
 
331 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  36.36 
 
 
330 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  36.73 
 
 
339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
331 aa  194  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  37.54 
 
 
340 aa  190  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  36.77 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  35.76 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  34.06 
 
 
345 aa  179  8e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  32.32 
 
 
332 aa  179  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 
341 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  31.81 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  32.59 
 
 
369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  33.13 
 
 
354 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  35.6 
 
 
346 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  36.91 
 
 
340 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  36.91 
 
 
340 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  35.6 
 
 
340 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  36.91 
 
 
340 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  34.12 
 
 
353 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  33.23 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  34.19 
 
 
398 aa  162  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  30.91 
 
 
336 aa  162  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  31.01 
 
 
361 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 
337 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  33.96 
 
 
346 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  30.42 
 
 
369 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  30.59 
 
 
334 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  31.17 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  34.18 
 
 
313 aa  129  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  31.03 
 
 
341 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
279 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  28.89 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  25.17 
 
 
279 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  23.79 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  23.43 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
302 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  31.55 
 
 
279 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  31.55 
 
 
279 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  31.55 
 
 
279 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  23.05 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  23.05 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  23.18 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  25.11 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  23.36 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  29.93 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  28.68 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  22.35 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  34.71 
 
 
306 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  33.78 
 
 
303 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  33.78 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  32 
 
 
318 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  33.78 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  22.74 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  24.63 
 
 
286 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  24.83 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  33.78 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  33.78 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  35.11 
 
 
280 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  35.11 
 
 
280 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 
317 aa  50.4  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
345 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  30.83 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  23.63 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  19.94 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  22.04 
 
 
345 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  20.25 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  27.48 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  27.8 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  19.86 
 
 
327 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
302 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
302 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
302 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
294 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  19.75 
 
 
337 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  20.25 
 
 
337 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  19.75 
 
 
337 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
264 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
277 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  22.36 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  19.44 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  29.37 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  31.25 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  19.44 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  30.16 
 
 
277 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
268 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  19.54 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0103  alpha/beta hydrolase  27.37 
 
 
277 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>