More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1548 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1548  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
235 aa  491  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.40436  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  39.56 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  34.7 
 
 
296 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
244 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
270 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
273 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 
249 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
249 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0852  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
247 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  46.24 
 
 
701 aa  95.5  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  31.67 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
284 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
271 aa  92  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3029  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  45.83 
 
 
257 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2972  WbdO  30.37 
 
 
248 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354784  hitchhiker  0.000000078637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
274 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
293 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  40.86 
 
 
605 aa  89.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 
1562 aa  89  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  41.23 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1538  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
270 aa  85.5  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.730305 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  47.78 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.86 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  39.78 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  34.12 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2118  HAD family hydrolase  27.55 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.690003  normal  0.751692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  37.17 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1235  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  36.46 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  44.83 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  39.58 
 
 
974 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11548  hypothetical protein  30.81 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  44.09 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  37.08 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  43.33 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1837  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  36 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4785  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
259 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0671462 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.14 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  36.46 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
450 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0750  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.61 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  41.94 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  42.53 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  28.22 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0025  glycosyl transferase family protein  43.75 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3053  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  41.24 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  39.08 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3252  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  41.11 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 
581 aa  73.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  45.45 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  36.56 
 
 
342 aa  72  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  39.56 
 
 
308 aa  72  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2582  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  35.56 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2772  b-glycosyltransferase  34.66 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107569  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  29.45 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  38 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30100  Glycosyl transferase, family 2 protein  36.36 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 
370 aa  69.3  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  38.95 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 
1032 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
289 aa  68.6  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  36.36 
 
 
325 aa  68.6  0.00000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  35.79 
 
 
300 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  39.18 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2769  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  34.41 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>