More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0706 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 
438 aa  891    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.43 
 
 
555 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.69 
 
 
554 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  39.43 
 
 
536 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  39.43 
 
 
536 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  35.69 
 
 
557 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  33.8 
 
 
521 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  33.8 
 
 
521 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  35.42 
 
 
538 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.33 
 
 
558 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.65 
 
 
626 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  38.1 
 
 
598 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.45 
 
 
605 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.83 
 
 
607 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.69 
 
 
597 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.69 
 
 
597 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  38.19 
 
 
594 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  33.76 
 
 
596 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.17 
 
 
615 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.48 
 
 
618 aa  132  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  38.46 
 
 
597 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  35.55 
 
 
595 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  35.55 
 
 
595 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.29 
 
 
593 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.5 
 
 
624 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.58 
 
 
610 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  31.11 
 
 
601 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.91 
 
 
610 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  36.82 
 
 
243 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.89 
 
 
586 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.92 
 
 
590 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  32.97 
 
 
601 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2064  mismatch repair ATPase  29.17 
 
 
427 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.02 
 
 
604 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  36.22 
 
 
590 aa  93.2  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  30.36 
 
 
956 aa  92  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.86 
 
 
443 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  39.29 
 
 
112 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  32.09 
 
 
864 aa  87.4  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.15 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.84 
 
 
445 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.75 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.35 
 
 
442 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  28.24 
 
 
918 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 
1085 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 
860 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0916  hypothetical protein  27.27 
 
 
685 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0756379 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  28.12 
 
 
968 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  29.26 
 
 
850 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0292  DNA mismatch repair protein MutS  26.97 
 
 
784 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.518405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  26.62 
 
 
1088 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.15 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  31.25 
 
 
815 aa  80.1  0.00000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  28.44 
 
 
878 aa  80.1  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  27.43 
 
 
903 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  28.77 
 
 
1205 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  27.73 
 
 
892 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  27.73 
 
 
890 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  27.1 
 
 
872 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 
892 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 
890 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  28.78 
 
 
848 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  28.93 
 
 
860 aa  77.4  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  29.79 
 
 
880 aa  77.4  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 
892 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 
892 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 
892 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 
892 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  30.67 
 
 
823 aa  76.6  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  30.57 
 
 
883 aa  76.6  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 
890 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  31.88 
 
 
893 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  26.82 
 
 
894 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  29.17 
 
 
817 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  27.19 
 
 
859 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  26 
 
 
874 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  27.73 
 
 
895 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1359  DNA mismatch repair protein MutS  26.53 
 
 
870 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  0.0149931 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  27.61 
 
 
857 aa  75.1  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  27.56 
 
 
793 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  27.56 
 
 
793 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  28.8 
 
 
858 aa  74.3  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  27.47 
 
 
913 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  25.86 
 
 
865 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  27.64 
 
 
908 aa  73.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  27.36 
 
 
846 aa  73.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  27.67 
 
 
903 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  26.85 
 
 
917 aa  73.6  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  25.51 
 
 
862 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  27.67 
 
 
857 aa  73.6  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  30.65 
 
 
819 aa  73.2  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  28.85 
 
 
858 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 
873 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  26.89 
 
 
846 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  26.96 
 
 
873 aa  71.2  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  34.76 
 
 
867 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  31.05 
 
 
897 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4552  DNA mismatch repair protein MutS  26.02 
 
 
871 aa  70.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  27.39 
 
 
882 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 
882 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>