More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2347 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2347  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 475 aa  942    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0151  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.45 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 		 465 aa  332  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.62 
 
 		 463 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.62 
 
 		 470 aa  317  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 		 473 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 		 470 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.15 
 
 		 463 aa  309  9e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.67 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 473 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.67 
 
 		 476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.67 
 
 		 476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.67 
 
 		 476 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.75 
 
 		 473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.81 
 
 		 467 aa  305  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.92 
 
 		 471 aa  305  9.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.46 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.46 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.46 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.46 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.46 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.13 
 
 		 473 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.82 
 
 		 492 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.25 
 
 		 476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.25 
 
 		 476 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.62 
 
 		 468 aa  302  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.04 
 
 		 476 aa  302  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.87 
 
 		 491 aa  302  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.04 
 
 		 476 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.04 
 
 		 476 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 		 467 aa  300  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.83 
 
 		 476 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  37.53 
 
 		 468 aa  299  8e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.49 
 
 		 475 aa  299  9e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.21 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 		 467 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.82 
 
 		 466 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.58 
 
 		 468 aa  297  3e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.39 
 
 		 464 aa  297  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.2 
 
 		 476 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.15 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.08 
 
 		 480 aa  296  6e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.96 
 
 		 471 aa  295  9e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 		 467 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.49 
 
 		 466 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.94 
 
 		 465 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.79 
 
 		 464 aa  295  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.78 
 
 		 468 aa  294  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.09 
 
 		 469 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.63 
 
 		 470 aa  294  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 		 467 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 		 467 aa  293  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  38 
 
 		 476 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.43 
 
 		 459 aa  292  9e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.31 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.58 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.58 
 
 		 462 aa  291  3e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.41 
 
 		 467 aa  291  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.32 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 459 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.8 
 
 		 481 aa  290  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.3 
 
 		 478 aa  290  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.38 
 
 		 473 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.39 
 
 		 471 aa  289  7e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.09 
 
 		 478 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.82 
 
 		 470 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.85 
 
 		 467 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.75 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.87 
 
 		 471 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.52 
 
 		 474 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.33 
 
 		 478 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.48 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.89 
 
 		 616 aa  288  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.88 
 
 		 625 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.12 
 
 		 459 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  39.32 
 
 		 459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 		 467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.29 
 
 		 466 aa  286  4e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.62 
 
 		 468 aa  287  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  37.72 
 
 		 464 aa  286  5e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.55 
 
 		 475 aa  286  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4216  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.33 
 
 		 598 aa  286  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.88 
 
 		 593 aa  286  8e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.79 
 
 		 480 aa  286  8e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.46 
 
 		 478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.32 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.82 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.92 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>