More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1336 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  33.96 
 
 		 3108 aa  638    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  35.44 
 
 		 1911 aa  660    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 1465 aa  2982    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  33.81 
 
 		 3093 aa  633  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  41.05 
 
 		 1574 aa  630  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  40.96 
 
 		 1582 aa  630  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  33.38 
 
 		 3089 aa  632  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  39.32 
 
 		 1424 aa  626  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  40.89 
 
 		 4646 aa  623  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  34.64 
 
 		 1560 aa  624  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  30.46 
 
 		 2316 aa  619  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  38.64 
 
 		 1653 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  32.06 
 
 		 1833 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  39.65 
 
 		 3090 aa  615  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  42.51 
 
 		 1520 aa  615  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  41.3 
 
 		 1489 aa  610  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  34.3 
 
 		 1795 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  40.54 
 
 		 1470 aa  600  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  41.14 
 
 		 1535 aa  603  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  39.78 
 
 		 1466 aa  599  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  39.1 
 
 		 1646 aa  595  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  33.95 
 
 		 1466 aa  591  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  40.37 
 
 		 1488 aa  588  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  41.4 
 
 		 974 aa  588  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  40.23 
 
 		 1472 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  40.23 
 
 		 1472 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  40.43 
 
 		 1302 aa  587  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  40.34 
 
 		 1472 aa  589  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  38.36 
 
 		 1909 aa  583  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  41.68 
 
 		 2498 aa  582  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  32.75 
 
 		 1497 aa  578  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  41.07 
 
 		 2684 aa  570  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  31.55 
 
 		 3130 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  40.2 
 
 		 2093 aa  564  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  38.65 
 
 		 995 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  37.69 
 
 		 4186 aa  562  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  39.39 
 
 		 4647 aa  562  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  38.43 
 
 		 995 aa  559  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  38.81 
 
 		 2682 aa  553  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  37.1 
 
 		 2710 aa  551  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  39.6 
 
 		 2454 aa  547  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  39.62 
 
 		 2150 aa  541  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  36.58 
 
 		 1408 aa  542  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  37.53 
 
 		 2679 aa  541  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  36.05 
 
 		 2176 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  37.54 
 
 		 1612 aa  536  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  37.43 
 
 		 1612 aa  535  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  32.22 
 
 		 2226 aa  530  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  40.04 
 
 		 2604 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  36.71 
 
 		 2273 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  37.36 
 
 		 3335 aa  515  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  37.5 
 
 		 3194 aa  512  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  38.91 
 
 		 1486 aa  505  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  32.3 
 
 		 2243 aa  501  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  37.32 
 
 		 1416 aa  500  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  38.81 
 
 		 4265 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  39.86 
 
 		 6889 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  38.81 
 
 		 4239 aa  492  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  38.81 
 
 		 4265 aa  493  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.47 
 
 		 2551 aa  479  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  35.22 
 
 		 1354 aa  475  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.08 
 
 		 1337 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  38.45 
 
 		 3133 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.21 
 
 		 1656 aa  470  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  38.45 
 
 		 3127 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  40.72 
 
 		 1000 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  33.59 
 
 		 1087 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.25 
 
 		 2762 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 1874 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  35.88 
 
 		 1587 aa  456  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  34.98 
 
 		 2462 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 		 2551 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  37.51 
 
 		 2880 aa  452  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  35.62 
 
 		 3163 aa  452  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  35.54 
 
 		 3275 aa  453  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  34.21 
 
 		 1349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.15 
 
 		 1349 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  35.97 
 
 		 4478 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  35.91 
 
 		 3173 aa  439  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  35.24 
 
 		 3676 aa  439  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  33.41 
 
 		 1559 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  36.64 
 
 		 4080 aa  436  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  38.1 
 
 		 3424 aa  435  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.05 
 
 		 1559 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  36.33 
 
 		 3176 aa  429  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.51 
 
 		 3693 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.51 
 
 		 3693 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.84 
 
 		 3702 aa  429  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  34.64 
 
 		 3679 aa  425  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 		 5400 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  34.57 
 
 		 1524 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  35.29 
 
 		 2477 aa  425  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  35.08 
 
 		 3696 aa  427  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  35.78 
 
 		 3254 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 		 3645 aa  423  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  34.07 
 
 		 1528 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  36.1 
 
 		 3508 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  33.92 
 
 		 1530 aa  416  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.74 
 
 		 1939 aa  417  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  33.92 
 
 		 1530 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>