88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3318 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3318  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5473  Methyltransferase type 12  36.22 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  35.21 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1619  methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  28.97 
 
 		 396 aa  55.5  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 519 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  27.72 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 531 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 		 527 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  28.77 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  32.61 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 		 527 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  26.37 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.1 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  29.76 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.07 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.95 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.44 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.25 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.41 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4680  methyltransferase type 11  25.34 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  26.25 
 
 		 272 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.88 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.88 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  28.81 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.71 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.69 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.27 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.67 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  30.63 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.46 
 
 		 329 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  25.17 
 
 		 391 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.18 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.35 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.41 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 276 aa  45.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.51 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.51 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  31.51 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.39 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  27.85 
 
 		 318 aa  45.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.51 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.51 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3122  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.61 
 
 		 516 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.89 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  25.95 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  28.05 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0640  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.18 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.37 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  21.91 
 
 		 457 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  23.13 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  25 
 
 		 401 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  27.43 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.58 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 581 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.54 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  28 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.33 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.14 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  26.62 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 		 333 aa  43.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  30 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 333 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1601  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.624379  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.19 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 323 aa  42.4  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 323 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  29.93 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.34 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.68 
 
 		 249 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  37.65 
 
 		 237 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3033  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 304 aa  42  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0786  Methyltransferase type 12  25.88 
 
 		 539 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 226 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  37.65 
 
 		 237 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  38.67 
 
 		 237 aa  42  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>