70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3247 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  55.88 
 
 
301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  51.16 
 
 
330 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  52.38 
 
 
303 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  48.04 
 
 
316 aa  265  7e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  45.59 
 
 
348 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  35.2 
 
 
323 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  36.2 
 
 
319 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  46.19 
 
 
396 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  36.2 
 
 
319 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  36.49 
 
 
323 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  33.57 
 
 
318 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  32.37 
 
 
315 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  36.53 
 
 
375 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  35.61 
 
 
320 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  36.97 
 
 
375 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  36.55 
 
 
376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  39.65 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  36.89 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  34.35 
 
 
451 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  32.58 
 
 
378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  32.06 
 
 
378 aa  125  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  32.55 
 
 
382 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  32.41 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  31.05 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  30.99 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  32.06 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  28.8 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  30.45 
 
 
377 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  32.4 
 
 
384 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  33.7 
 
 
261 aa  105  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  33.7 
 
 
261 aa  105  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  33.22 
 
 
385 aa  105  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  30.42 
 
 
382 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  28.92 
 
 
375 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  30.13 
 
 
378 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  27.93 
 
 
392 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  30.67 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  29.55 
 
 
379 aa  95.9  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.51 
 
 
618 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  30.09 
 
 
379 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  31.25 
 
 
441 aa  87.8  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  29.36 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  25 
 
 
371 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  31.22 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  24.81 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  24.26 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  31.91 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  28.51 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  31.66 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  30.13 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  30.13 
 
 
293 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  27.52 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  27.27 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  30.13 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  26.22 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  29.61 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  29.09 
 
 
309 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  27.39 
 
 
442 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  28.38 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  26.98 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  27.04 
 
 
396 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  22.32 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  23.45 
 
 
301 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  26.19 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  24.71 
 
 
505 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  28.38 
 
 
282 aa  48.5  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  28.35 
 
 
479 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  25.13 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  25.93 
 
 
377 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.01191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>