More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1690 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1690  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
460 aa  934    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416898  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1653  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.33 
 
 
456 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000183758  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.6 
 
 
473 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100657 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.57 
 
 
453 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1416  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.6 
 
 
461 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1580  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.91 
 
 
456 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.809434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  35 
 
 
465 aa  256  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.76 
 
 
470 aa  246  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 
472 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.05 
 
 
468 aa  243  6e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
473 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.84 
 
 
459 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.84 
 
 
459 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.41 
 
 
473 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.13 
 
 
474 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.24 
 
 
460 aa  239  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.14 
 
 
562 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 
478 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 
478 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 
466 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.9 
 
 
473 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 
459 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.56 
 
 
478 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.13 
 
 
468 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.45 
 
 
468 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1632  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.08 
 
 
483 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 
478 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.06 
 
 
467 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 
478 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 
607 aa  237  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.91 
 
 
477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 
466 aa  236  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.37 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  32.35 
 
 
478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.79 
 
 
466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.56 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.36 
 
 
463 aa  234  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.42 
 
 
467 aa  234  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 
459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
469 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.2 
 
 
467 aa  233  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.97 
 
 
472 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.4 
 
 
581 aa  232  8.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 
466 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.98 
 
 
478 aa  232  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 
459 aa  232  9e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
474 aa  232  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.96 
 
 
459 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.46 
 
 
602 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 
463 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.36 
 
 
466 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  31.8 
 
 
464 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.97 
 
 
473 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  34 
 
 
459 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.33 
 
 
462 aa  230  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.84 
 
 
463 aa  231  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.13 
 
 
468 aa  230  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
469 aa  230  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
466 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.53 
 
 
481 aa  230  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 
466 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.95 
 
 
459 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.19 
 
 
473 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1494  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.13 
 
 
473 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  34.75 
 
 
472 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 
459 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.43 
 
 
468 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.97 
 
 
603 aa  228  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.62 
 
 
466 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
466 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
468 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.51 
 
 
463 aa  228  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.85 
 
 
477 aa  227  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.99 
 
 
466 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.97 
 
 
603 aa  227  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 
468 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
466 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.12 
 
 
478 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 
473 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.04 
 
 
459 aa  227  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  33.12 
 
 
466 aa  227  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0421  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
475 aa  227  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000187748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
467 aa  227  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.12 
 
 
478 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.99 
 
 
480 aa  226  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 
467 aa  226  7e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.64 
 
 
467 aa  226  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0235  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
466 aa  226  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  33.92 
 
 
462 aa  226  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  31.24 
 
 
468 aa  225  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.66 
 
 
461 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 
471 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.04 
 
 
464 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
459 aa  225  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.45 
 
 
466 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
467 aa  225  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.05 
 
 
475 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
473 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>