More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3132 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3132  histidine kinase  100 
 
 		 402 aa  822    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.752444  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3224  histidine kinase  71.02 
 
 		 389 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2693  histidine kinase  49.74 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.751419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3085  sensor histidine kinase  45.55 
 
 		 391 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.389389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04835  two-component system sensor protein  43.78 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 425 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2773  histidine kinase  35.97 
 
 		 374 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  33.15 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1791  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.813908  normal  0.38268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.58 
 
 		 455 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 352 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 493 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3973  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 364 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.72 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.09 
 
 		 460 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.44 
 
 		 453 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00300746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.2 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0122  histidine kinase  32.56 
 
 		 392 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  34.65 
 
 		 482 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 368 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  35.62 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 471 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 467 aa  160  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 382 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 383 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.44 
 
 		 467 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 358 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  40.07 
 
 		 423 aa  159  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 357 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.55 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.02 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.55 
 
 		 467 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.55 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.55 
 
 		 467 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.55 
 
 		 467 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 471 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2736  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6826  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.4 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 483 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.4 
 
 		 467 aa  156  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.55 
 
 		 467 aa  156  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  35.43 
 
 		 518 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5743  histidine kinase  34.04 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.022107  hitchhiker  0.000697261 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 518 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.33 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  37.02 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  37.02 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  36.62 
 
 		 516 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.77 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.02 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.63 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.02 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  37.02 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.63 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  35.21 
 
 		 449 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  35.77 
 
 		 354 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  34.94 
 
 		 470 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 389 aa  152  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  35.85 
 
 		 593 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 458 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  35.09 
 
 		 473 aa  150  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  32.98 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 408 aa  150  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  38.27 
 
 		 594 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  33 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  34.39 
 
 		 369 aa  145  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  30.27 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 483 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 437 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  34.05 
 
 		 360 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  28.72 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 458 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 507 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4195  histidine kinase  35.8 
 
 		 592 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445902  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 451 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 358 aa  140  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 369 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 385 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 360 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  30.62 
 
 		 465 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 379 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 379 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  33.22 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  30.33 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 463 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  25.17 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 589 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>