50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2620 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2620  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
196 aa  408  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.592321  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  60 
 
 
209 aa  258  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  60.51 
 
 
196 aa  257  8e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  60 
 
 
196 aa  256  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0925  hypothetical protein  38.54 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339303  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1997  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.36 
 
 
185 aa  141  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.418492  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3299  hypothetical protein  39.01 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5225  hypothetical protein  39.01 
 
 
242 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.408717  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1414  hypothetical protein  32.83 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563385  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2891  hypothetical protein  37.91 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4151  hypothetical protein  36.81 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.807728  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4803  hypothetical protein  36.81 
 
 
244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3365  hypothetical protein  36.81 
 
 
244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5960  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.46 
 
 
237 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4625  hypothetical protein  33.69 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.05 
 
 
216 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.87 
 
 
233 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  32.32 
 
 
236 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  29.74 
 
 
233 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  34.81 
 
 
226 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0926  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.18 
 
 
228 aa  96.7  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  normal  0.0485806 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0511  hypothetical protein  23.3 
 
 
253 aa  63.9  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.29 
 
 
195 aa  61.2  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  33.71 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.12 
 
 
295 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  24.26 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.2 
 
 
186 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.4 
 
 
294 aa  48.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.81 
 
 
192 aa  47.8  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  23.78 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  29.59 
 
 
291 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.12 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  25.81 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  28.12 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  21.97 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  26.92 
 
 
209 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  23 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  26.04 
 
 
292 aa  44.3  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.9 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  24.85 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  25 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  23.38 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.84 
 
 
190 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  25.53 
 
 
196 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  23.6 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  22.69 
 
 
192 aa  42  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  22.69 
 
 
192 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0076  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  23.26 
 
 
160 aa  42  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  25 
 
 
209 aa  42  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.39 
 
 
195 aa  41.2  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>