More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0299 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 431 aa  862    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  79.53 
 
 		 432 aa  686    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 452 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 436 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  38.04 
 
 		 436 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  38.53 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  38.53 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  38.53 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  40.19 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  37.39 
 
 		 447 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 447 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 450 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 439 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  40 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  40 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  39.08 
 
 		 440 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  36.21 
 
 		 427 aa  279  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 439 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 446 aa  249  9e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 435 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.18 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 443 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  33.49 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  33.57 
 
 		 434 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  33.41 
 
 		 454 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  32.55 
 
 		 449 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 436 aa  240  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  33.17 
 
 		 454 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  33.17 
 
 		 454 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  32.71 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 469 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  34.93 
 
 		 436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 463 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 464 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.3 
 
 		 448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 453 aa  232  8.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  32.47 
 
 		 453 aa  232  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  34.93 
 
 		 436 aa  232  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 461 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 466 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  32.2 
 
 		 450 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  32.71 
 
 		 444 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  32.71 
 
 		 444 aa  229  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  32.71 
 
 		 444 aa  229  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  32.71 
 
 		 444 aa  229  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  32.71 
 
 		 444 aa  229  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 455 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  32.71 
 
 		 444 aa  229  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  32.71 
 
 		 444 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  35.18 
 
 		 419 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  35.17 
 
 		 478 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  32.71 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 449 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  32.94 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  32.94 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 447 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  32.42 
 
 		 450 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.31 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  34.31 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.31 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.31 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.31 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  34.31 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.31 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  31.44 
 
 		 458 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  32.07 
 
 		 451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  32.37 
 
 		 459 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 444 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.17 
 
 		 456 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>