More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2415 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2315  ABC transporter related  82.7 
 
 
503 aa  850    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0829639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2423  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  72.44 
 
 
513 aa  749    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1662  ABC transporter related  78.53 
 
 
503 aa  820    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0101569  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2520  ABC transporter related  71.73 
 
 
518 aa  748    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.265677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3218  ABC transporter-related protein  73.16 
 
 
503 aa  751    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0134521 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2415  ABC transporter related  100 
 
 
503 aa  1018    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.543063  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1933  ABC transporter related protein  77.93 
 
 
503 aa  818    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0512785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1135  ABC transporter related  71.23 
 
 
500 aa  734    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  47.47 
 
 
498 aa  485  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0844  ABC transporter related  41.94 
 
 
515 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.68 
 
 
496 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  41.52 
 
 
503 aa  381  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  35.96 
 
 
501 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1739  ABC transporter related protein  41.94 
 
 
516 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  39.17 
 
 
517 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.2 
 
 
499 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  40.04 
 
 
500 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  39.39 
 
 
506 aa  369  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.16 
 
 
497 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  37.28 
 
 
505 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  35.83 
 
 
504 aa  365  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  43.23 
 
 
509 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  39.28 
 
 
507 aa  364  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.28 
 
 
507 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  41.32 
 
 
519 aa  363  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  39.68 
 
 
515 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 
492 aa  362  1e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  39.02 
 
 
501 aa  360  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  39.92 
 
 
497 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  39.08 
 
 
507 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
517 aa  359  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  39.52 
 
 
517 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  38.23 
 
 
506 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  39.92 
 
 
514 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  39.52 
 
 
512 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  39.92 
 
 
514 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  39.24 
 
 
500 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  36.42 
 
 
496 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  36.62 
 
 
496 aa  356  5e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  39.68 
 
 
514 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  39.96 
 
 
508 aa  356  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  37.75 
 
 
499 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  39.47 
 
 
520 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 
494 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  36.57 
 
 
494 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 
494 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 
494 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
494 aa  355  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  37.6 
 
 
494 aa  354  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.85 
 
 
504 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  38.98 
 
 
499 aa  354  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 
499 aa  353  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  39.52 
 
 
504 aa  353  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  40.45 
 
 
514 aa  353  4e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  39.96 
 
 
503 aa  353  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.98 
 
 
499 aa  353  5e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.08 
 
 
510 aa  353  5e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  39.15 
 
 
513 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  39.92 
 
 
516 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 
494 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  39.55 
 
 
512 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
494 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  38.34 
 
 
509 aa  351  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  38 
 
 
505 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 
494 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.08 
 
 
512 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  38.09 
 
 
505 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  38.95 
 
 
513 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  38.59 
 
 
508 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  38.41 
 
 
501 aa  351  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  38.45 
 
 
513 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  40.08 
 
 
530 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  39.17 
 
 
512 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  38.01 
 
 
495 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  38.62 
 
 
513 aa  350  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  38.49 
 
 
506 aa  349  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0936  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 
529 aa  349  8e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.411664  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0878  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 
529 aa  349  8e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  39.48 
 
 
500 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  40.85 
 
 
502 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  38.93 
 
 
514 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  37.32 
 
 
519 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2253  ABC transporter-related protein  40.88 
 
 
505 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000512006 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  37.4 
 
 
495 aa  348  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  38.8 
 
 
506 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  38.68 
 
 
503 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  38.82 
 
 
497 aa  348  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  38.41 
 
 
495 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  36.35 
 
 
506 aa  348  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  39.55 
 
 
512 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  35.43 
 
 
492 aa  347  3e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  39.55 
 
 
512 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  36.64 
 
 
499 aa  347  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  36.78 
 
 
507 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  38.13 
 
 
495 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  38.09 
 
 
508 aa  346  6e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  37.93 
 
 
519 aa  346  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  40.17 
 
 
499 aa  346  6e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  38.68 
 
 
515 aa  346  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  38.99 
 
 
499 aa  346  7e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>