More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2377 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 267 aa  536  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  51.96 
 
 		 287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  50.88 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  48.19 
 
 		 294 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  49.62 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  44.93 
 
 		 291 aa  236  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  46.35 
 
 		 292 aa  234  8e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  47.45 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  49.44 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  47.83 
 
 		 294 aa  228  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  48.12 
 
 		 285 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  48.33 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  48.33 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  48.33 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  48.73 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  43.15 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  46.32 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  43.01 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  45.59 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  47.62 
 
 		 292 aa  221  8e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  46.99 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  43.36 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  45.42 
 
 		 292 aa  218  7.999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  45.55 
 
 		 307 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.76 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  50 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  46.18 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  45.26 
 
 		 289 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  50 
 
 		 303 aa  215  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  43.38 
 
 		 292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  43.38 
 
 		 292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  45.82 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  42.7 
 
 		 292 aa  214  8e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  43.43 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  45.02 
 
 		 307 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  45.62 
 
 		 290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  45.13 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.93 
 
 		 289 aa  208  9e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  42.36 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  41.09 
 
 		 275 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  43.45 
 
 		 312 aa  205  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  42.01 
 
 		 312 aa  205  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  41.24 
 
 		 310 aa  205  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  43.7 
 
 		 290 aa  205  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 296 aa  204  9e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 296 aa  204  9e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  43.27 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  43.32 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  44.01 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  41.4 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  41.61 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  41.61 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  43.22 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  42.49 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  45.26 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  41.96 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  42.12 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  42.49 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  46.1 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  42.49 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  42.49 
 
 		 292 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  41.32 
 
 		 307 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  42.12 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  44.64 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  40.91 
 
 		 288 aa  199  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  39.51 
 
 		 303 aa  198  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 301 aa  198  7e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  44.09 
 
 		 291 aa  198  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  41.76 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  41.76 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  41.76 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  41.76 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  41.76 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  44.19 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  41.76 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  41.76 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  42.44 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  44.85 
 
 		 291 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  43.22 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  43.22 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  43.22 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  42.86 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  42.86 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  44 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  42.01 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  40.55 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  44 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  42.49 
 
 		 293 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  43.49 
 
 		 310 aa  195  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  42.01 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  40.97 
 
 		 310 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  43.64 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  43.64 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  43.64 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>