More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2014 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2014  aminotransferase class I and II  100 
 
 
398 aa  820    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.726658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0088  aminotransferase class I and II  59.14 
 
 
399 aa  478  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  41.34 
 
 
392 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  35.18 
 
 
387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  40.6 
 
 
393 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  40.37 
 
 
399 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4903  aminotransferase class I and II  38.24 
 
 
392 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234248  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  38.36 
 
 
393 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  38.44 
 
 
392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  37.11 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  36.84 
 
 
393 aa  234  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2610  aminotransferase class I and II  37.63 
 
 
393 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.436935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  37.63 
 
 
395 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2719  aminotransferase  36.84 
 
 
392 aa  223  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  34.12 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  32.32 
 
 
392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  33.5 
 
 
392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  33.75 
 
 
400 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  32.49 
 
 
389 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  33.25 
 
 
380 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  31.42 
 
 
397 aa  206  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  31.17 
 
 
397 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  31.84 
 
 
382 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  33.15 
 
 
386 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  29.95 
 
 
397 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  32.45 
 
 
400 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  29.97 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  32.38 
 
 
401 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  33.06 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  32.12 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  32.48 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4172  aminotransferase  35.28 
 
 
389 aa  199  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000308334  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  31.74 
 
 
398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  34.2 
 
 
398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  31.2 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  30.61 
 
 
400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  33.15 
 
 
400 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  33.15 
 
 
400 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  30.81 
 
 
399 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  31.34 
 
 
400 aa  196  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  32.15 
 
 
400 aa  196  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  31.34 
 
 
400 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  31.34 
 
 
400 aa  195  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  33.23 
 
 
386 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  32.51 
 
 
396 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  32.15 
 
 
400 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  32.65 
 
 
390 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 
400 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  32.24 
 
 
388 aa  194  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  31.88 
 
 
400 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  32.15 
 
 
400 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  32.49 
 
 
400 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  32.97 
 
 
400 aa  193  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  32.18 
 
 
379 aa  193  5e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  33.15 
 
 
400 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  31.61 
 
 
400 aa  192  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  30.46 
 
 
397 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  32.04 
 
 
400 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  32.74 
 
 
387 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  31.61 
 
 
401 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  32.53 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  29.32 
 
 
395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  32.43 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  32.69 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
400 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  29.32 
 
 
395 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  34.4 
 
 
397 aa  190  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  28.21 
 
 
397 aa  190  5e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  34.93 
 
 
389 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  32.84 
 
 
400 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  30.5 
 
 
395 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  29.9 
 
 
387 aa  189  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  31.44 
 
 
400 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  31.79 
 
 
406 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 
402 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  29.32 
 
 
395 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  31.98 
 
 
400 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  31.41 
 
 
400 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  29.47 
 
 
399 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  28.82 
 
 
395 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  28.82 
 
 
395 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  28.82 
 
 
395 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  28.82 
 
 
395 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  28.82 
 
 
395 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  31.47 
 
 
380 aa  186  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  29.07 
 
 
395 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  30.75 
 
 
417 aa  186  7e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  31.79 
 
 
409 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  32.16 
 
 
396 aa  186  8e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
390 aa  186  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  32.99 
 
 
415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  32.73 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  28.82 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  28.72 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  31.96 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  32.69 
 
 
402 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  31.4 
 
 
401 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  31.34 
 
 
401 aa  184  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  33.51 
 
 
394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  29.5 
 
 
396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>