More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1412 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1412  histidine kinase  100 
 
 		 381 aa  788    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2053  histidine kinase  39.25 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2970  histidine kinase  40.16 
 
 		 386 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1375  histidine kinase  39.58 
 
 		 447 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2301  histidine kinase  39 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229596 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 377 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0902  histidine kinase  39.89 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000164355  hitchhiker  0.00000000561176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2189  sensor histidine kinase  36.73 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2287  histidine kinase  38.57 
 
 		 387 aa  236  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000635078  normal  0.170007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2728  histidine kinase  38.48 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1890  histidine kinase  38.68 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00251613  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3006  histidine kinase  35.58 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0278  histidine kinase  34.95 
 
 		 406 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.284649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3366  histidine kinase  31.28 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0880  histidine kinase  32 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216006 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2934  histidine kinase  35.88 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3335  histidine kinase  32.53 
 
 		 404 aa  162  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248975  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1696  histidine kinase  29.17 
 
 		 380 aa  143  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0566842  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 589 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2278  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.530752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3521  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.36 
 
 		 1022 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 1519 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6300  histidine kinase  26.05 
 
 		 1255 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  32.35 
 
 		 573 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 581 aa  63.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  28.57 
 
 		 830 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 589 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 571 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0709  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.737809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 723 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 810 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 905 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 468 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  27.41 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 781 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  27.38 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 581 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 594 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2387  histidine kinase  36.52 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  34.88 
 
 		 1347 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1030  histidine kinase  25.45 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.975788  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0636  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318643  normal  0.125988 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  30.9 
 
 		 1006 aa  57.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  30.23 
 
 		 581 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  33.87 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4312  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 591 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 		 768 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 		 768 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2043  histidine kinase  36.84 
 
 		 560 aa  56.6  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  28.46 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  33.83 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 		 768 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.64 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 677 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2107  hypothetical protein  25.66 
 
 		 676 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2460  histidine kinase  33.63 
 
 		 415 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 645 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  28.24 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1912  putative PAS/PAC sensor protein  27.64 
 
 		 201 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.436176  unclonable  0.00000739148 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.27 
 
 		 738 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 494 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1627  histidine kinase  29.07 
 
 		 538 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 507 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0550144  normal  0.563731 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 		 545 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 546 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 1527 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 1002 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 631 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 562 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0308  histidine kinase  33.15 
 
 		 707 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3414  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 		 406 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  25.3 
 
 		 393 aa  54.3  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 770 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  26.23 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 591 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.456575  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 883 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  35.96 
 
 		 628 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3020  histidine kinase  33.96 
 
 		 1282 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  27.19 
 
 		 470 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 477 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  27.06 
 
 		 646 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04306  histidine kinase-response regulator hybrid protein  28.69 
 
 		 500 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.717782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0774  sensor histidine kinase  39.58 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0319  histidine kinase  33.15 
 
 		 707 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  27.2 
 
 		 766 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 		 642 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2392  histidine kinase  29.82 
 
 		 502 aa  53.5  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>