69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1182 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 		 148 aa  288  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.55 
 
 		 171 aa  87.4  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.42 
 
 		 171 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  34.04 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.8 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  36.59 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  32.8 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  32.85 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  32.85 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  32.09 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  29.86 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.57 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3570  hemerythrin HHE cation binding region  34.92 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  32.62 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.43 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2719  hypothetical protein  27.03 
 
 		 407 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.4 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3837  hypothetical protein  27.4 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0111576  normal  0.104463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  38.51 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2534  hypothetical protein  25.68 
 
 		 495 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2543  hypothetical protein  30.23 
 
 		 216 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771916  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2004  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.31 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.43 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.43 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.81 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.12 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  31.21 
 
 		 178 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.88 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1828  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1764  hypothetical protein  30.66 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3465  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  30.41 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  27.78 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  28.47 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  29.27 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7614  hypothetical protein  25.68 
 
 		 395 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.08 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.24 
 
 		 345 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.6 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3909  hemerythrin HHE cation binding region  32.14 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.2 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  27.34 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.76 
 
 		 350 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0996  hypothetical protein  27.97 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.457689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.72 
 
 		 235 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.62 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.36 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  27.5 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3133  hypothetical protein  38.16 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.93 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  24.82 
 
 		 228 aa  45.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  21.74 
 
 		 346 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  27.5 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2142  hemerythrin HHE cation binding region  29.73 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3032  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.9 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1926  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.58 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.669043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3007  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442011  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4750  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.26 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.777475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1992  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.58 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.709277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1946  hemerythrin HHE cation binding region  25.58 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.36 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2722  hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.9 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  21.68 
 
 		 347 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  20.57 
 
 		 351 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.08 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4228  hemerythrin HHE cation binding region  25.19 
 
 		 196 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2860  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.79 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184327  normal  0.243367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>