More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2468 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2468  arginase  100 
 
 
306 aa  622  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  48.3 
 
 
309 aa  241  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  43.36 
 
 
309 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  47.28 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  43.49 
 
 
301 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  47.8 
 
 
309 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.57 
 
 
315 aa  198  7.999999999999999e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  36.68 
 
 
302 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  36.08 
 
 
298 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  36.62 
 
 
300 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  35.59 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  34.26 
 
 
297 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  36.43 
 
 
315 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  35.34 
 
 
299 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  34.39 
 
 
297 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  34.36 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  34.78 
 
 
298 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  33.33 
 
 
297 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  33.33 
 
 
297 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  33.33 
 
 
297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  41.2 
 
 
299 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  36.46 
 
 
308 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  33.68 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  33.33 
 
 
297 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  33.33 
 
 
297 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  39.35 
 
 
299 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  36.43 
 
 
307 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  33.33 
 
 
297 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  33.33 
 
 
297 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  33.33 
 
 
297 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  33.33 
 
 
297 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  34.47 
 
 
301 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  34.92 
 
 
306 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  31.4 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  34.47 
 
 
302 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  33.9 
 
 
299 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  33.56 
 
 
303 aa  142  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  31.63 
 
 
302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  31.49 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  37.05 
 
 
351 aa  133  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.36 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  31.13 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  31.45 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  30.63 
 
 
341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  32.89 
 
 
311 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  32.54 
 
 
319 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  29.27 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  29.27 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  31.53 
 
 
304 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  31.1 
 
 
306 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  31.21 
 
 
306 aa  128  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  30.77 
 
 
306 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  33.47 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  30.27 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  31.19 
 
 
311 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  31.54 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  31.63 
 
 
305 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  34.31 
 
 
310 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  32.33 
 
 
309 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  30.03 
 
 
307 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  33.33 
 
 
321 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  30.03 
 
 
304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  32.33 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  33.89 
 
 
318 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  31.83 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  30.2 
 
 
307 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  31.58 
 
 
309 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  30.8 
 
 
308 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  30.45 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  30.24 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  32.09 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  34.4 
 
 
306 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  29.61 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  34.4 
 
 
306 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  31.76 
 
 
308 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  30.64 
 
 
308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  31.42 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  29.63 
 
 
324 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  34.93 
 
 
301 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  29.24 
 
 
328 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.82 
 
 
315 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  32.57 
 
 
306 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  31.63 
 
 
327 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  32.56 
 
 
328 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  30.49 
 
 
324 aa  105  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  28.42 
 
 
309 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  27.88 
 
 
325 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  28.9 
 
 
326 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  25.31 
 
 
314 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  27.72 
 
 
331 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.95 
 
 
319 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  32.68 
 
 
356 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3869  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.74 
 
 
321 aa  99.4  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  33.78 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  33.33 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  33.8 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  29.92 
 
 
365 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  28.86 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  29.15 
 
 
346 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.05 
 
 
335 aa  92.4  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>